Question

我正在关注scikit文档的决策树教程。我有pydotplus 2.0.2，但它告诉我它没有write方法 - 下面的错误。我现在一直苦苦挣扎，有什么想法，好吗？非常感谢！

from sklearn import tree
from sklearn.datasets import load_iris

iris = load_iris()
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)

from IPython.display import Image

dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None)
import pydotplus

graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)

Image(graph.create_png())

我的错误是

    /Users/air/anaconda/bin/python /Users/air/PycharmProjects/kiwi/hemr.py
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/air/PycharmProjects/kiwi/hemr.py", line 10, in <module>
    dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None)
  File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/tree/export.py", line 375, in export_graphviz
    out_file.write('digraph Tree {\n')
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'write'

Process finished with exit code 1

-----更新-----

使用out_file修复，会引发另一个错误：

 Traceback (most recent call last):
  File "/Users/air/PycharmProjects/kiwi/hemr.py", line 13, in <module>
    graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)
  File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pydotplus/graphviz.py", line 302, in graph_from_dot_data
    return parser.parse_dot_data(data)
  File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pydotplus/parser.py", line 548, in parse_dot_data
    if data.startswith(codecs.BOM_UTF8):
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'startswith'

---- 更新2 -----

另外，下面我自己的答案解决了另一个问题

Answer 1

问题是您要将参数out_file设置为None。

如果查看documentation，如果将其设置为None，则会直接返回string文件，而不会创建文件。当然，string没有write方法。

因此，请执行以下操作：

dot_data = tree.export_graphviz(clf)
graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)

Answer 2

即使为1e6指定了正确的路径，方法graph_from_dot_data()也不适用于我。

而是尝试使用out_file方法：

graph_from_dot_file

Answer 3

今天早上我遇到了同样的错误。我使用python 3.x，这就是我解决问题的方法。

from sklearn import tree
from sklearn.datasets import load_iris
from IPython.display import Image
import io

iris = load_iris()
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)

# Let's give dot_data some space so it will not feel nervous any more
dot_data = io.StringIO()
tree.export_graphviz(clf, out_file=dot_data)
import pydotplus

graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
# make sure you have graphviz installed and set in path
Image(graph.create_png())

如果您使用python 2.x，我相信您需要更改＆＃34; import io＆＃34;为：

import StringIO

和

dot_data = StringIO.StringIO()

希望它有所帮助。

Answer 4

另一个问题是我的Graphviz的backend设置!!它很好地解决了here。您只需要查找该设置文件并更改后端，或者在注释中建议的代码mpl.use("TkAgg")中查找。在我只得到pydotplot无法找到我的Graphviz可执行文件的错误后，我通过自制程序重新安装了Graphviz：brew install graphviz解决了这个问题，我现在可以制作情节！

Answer 5

真正帮助我解决问题的是： - 我执行了安装graphviz的同一个用户的代码。因此，从任何其他用户执行将给出您的错误

Answer 6

我建议避免使用graphviz并使用以下替代方法

from sklearn.tree import plot_tree
plt.figure(figsize=(60,30))
plot_tree(clf, filled=True);

绘制决策树，graphvizm pydotplus

6 个答案: