R将线性模型传递给函数内的另一个函数

时间:2016-09-27 15:17:17

标签: r scoping mass-package

我正在努力寻找最佳的" lambda" Box-Cox转换的参数。

我正在使用 MASS 包中的实现,所以我只需要创建模型并提取lambda。

以下是该函数的代码:

library(MASS)

find_lambda <- function(x) {
  # Function to find the best lambda for the Box-Cox transform

  my_tmp <- data.frame(x = x) # Create a temporary data frame, to use it with the lm
  str(my_tmp) # Gives the expected output

  the_lm <- lm(x ~ 1, data = my_tmp) # Creates the linear model, no error here
  print(summary(the_lm)) # Prints the summary, as expected

  out <- boxcox(the_lm, plotit=FALSE) # Gives the error

  best_lambda <- out$x[which.max(out$y)] # Extracting the best fitting lambda
  return(best_lambda)
}

find_lambda(runif(100))

它出现以下错误:

Error in is.data.frame(data) : object 'my_tmp' not found 

有趣的是,相同的代码在函数外部工作。换句话说,出于某种原因, MASS 包中的 boxcox 函数正在全局环境中查找变量。

我真的不明白,到底发生了什么......你有什么想法吗?

P.S。我没有提供软件/硬件规范,因为这个错误已成功复制到我的一些朋友身上。笔记本电脑。

P.P.S。我找到了解决预测包中的初始问题的方法,但我仍然想知道为什么这段代码无效。

3 个答案:

答案 0 :(得分:4)

有时,用户提供的包并不总能很好地跟踪操作函数调用时执行调用的环境。最快的解决方法是从

更改行
the_lm <- lm(x ~ 1, data = my_tmp)

the_lm <- lm(x ~ 1, data = my_tmp, y=True, qr=True)

因为如果y调用未请求qrlmboxcox函数会尝试通过这些参数重新运行lm一个update调用,事情会在函数范围内被删除。

答案 1 :(得分:1)

为什么不让box-cox做拟合?

find_lambda <- function(x) {
  # Function to find the best lambda for the Box-Cox transform

  my_tmp <- data.frame(x = x) # Create a temporary data frame, to use it with the lm

  out <- boxcox(x ~ 1, data = my_tmp, plotit=FALSE) # Gives the error

  best_lambda <- out$x[which.max(out$y)] # Extracting the best fitting lambda
  return(best_lambda)
}

我认为您的范围界定问题是update.default eval(call, parent.frame()),而my_tmp环境中不存在boxcox和{{1}}。如果我错了,请纠正我。

答案 2 :(得分:0)

boxcox无法找到您的数据。这可能是因为一些范围问题 您可以将数据输入boxcox功能。

find_lambda <- function(x) {
  # Function to find the best lambda for the Box-Cox transform

  my_tmp <- data.frame(x = x) # Create a temporary data frame, to use it with the lm
  str(my_tmp) # Gives the expected output

  the_lm <- lm(x ~ 1, data = my_tmp) # Creates the linear model, no error here
  print(summary(the_lm)) # Prints the summary, as expected

  out <- boxcox(the_lm, plotit=FALSE, data = my_tmp) # feed data in here

  best_lambda <- out$x[which.max(out$y)] # Extracting the best fitting lambda
  return(best_lambda)
}

find_lambda(runif(100))