Question

我有一个名为weather.h5的h5商店。我的默认Python环境是3.5.2。当我尝试阅读这家商店时，我得到TypeError: Already tz-aware, use tz_convert to convert。

我已经尝试了pd.read_hdf('weather.h5','weather_history')和pd.io.pytables.HDFStore('weather.h5')['weather_history]，但无论如何我都会收到错误。

我可以在Python 2.7环境中打开h5。这是Python 3 / pandas中的错误吗？

Answer 1

我有同样的问题。我正在使用Anaconda Python：3.4.5和2.7.3。两者都在使用pandas 0.18.1。

这是一个可重复的例子：

generate.py（用Python2执行）：

import pandas as pd
from pandas import HDFStore

index = pd.DatetimeIndex(['2017-06-20 06:00:06.984630-05:00', '2017-06-20 06:03:01.042616-05:00'], dtype='datetime64[ns, CST6CDT]', freq=None)
p1 = [0, 1]
p2 = [0, 2]

# Saving any of these dataframes cause issues
df1 = pd.DataFrame({"p1":p1, "p2":p2}, index=index)
df2 = pd.DataFrame({"p1":p1, "p2":p2, "i":index})

store = HDFStore("./test_issue.h5")
store['df'] = df1
#store['df'] = df2
store.close()

read_issue.py：

import pandas as pd
from pandas import HDFStore

store = HDFStore("./test_issue.h5", mode="r")
df = store['/df']
store.close()

print(df)

在Python2中运行read_issue.py没有问题并产生此输出：

p1  p2
2017-06-20 11：00：06.984630-05：00 0 0 2017-06-20 11：03：01.042616-05：00 1 2

但是在Python3中运行它会产生这个回溯的错误：

追踪（最近一次通话）：文件“read_issue.py”，第5行，in df = store ['df'] 文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第417行， getitem return self.get（key）文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第634行，获取 return self._read_group（group）在_read_group中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第1272行返回s.read（** kwargs）文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第2779行，正在阅读 ax = self.read_index（'axis％d'％i）在read_index中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第2367行 _，index = self.read_index_node（getattr（self.group，key））在read_index_node中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第2492行 _unconvert_index（data，kind，encoding = self.encoding），** kwargs）在新中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/indexes/base.py”，第153行 result = DatetimeIndex（data，copy = copy，name = name，** kwargs）在包装器中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/util/decorators.py”，第91行 return func（* args，** kwargs）在新中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/tseries/index.py”，第321行引发TypeError（“已经知道tz，使用tz_convert” TypeError：已经识别tz，使用tz_convert进行转换。关闭剩余的打开文件：./ test_issue.h5 ...已完成

因此，索引存在问题。但是，如果在generate.py中保存df2（datetime作为列而不是索引），则read_issue.py中的Python3会产生不同的错误：

追踪（最近一次通话）：文件“read_issue.py”，第5行，in df = store ['/ df'] 文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第417行， getitem return self.get（key）文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第634行，获取 return self._read_group（group）在_read_group中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第1272行返回s.read（** kwargs）文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py”，第2788行，正在阅读放置= items.get_indexer（blk_items））在make_block中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/core/internals.py”，第2518行 return klass（values，ndim = ndim，fastpath = fastpath，placement = placement）在 init 中输入文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/core/internals.py”，第90行 LEN（self.mgr_locs））） ValueError：传递的项目数量错误2，展示位置意味着1 关闭剩余的打开文件：./ test_issue.h5 ...已完成

另外，如果你在Python3中执行generate_issue.py（保存df1或df2），那么在Python3或Python2中执行read_issue.py都没有问题

使用pandas，python 3（但不是2）读取h5文件时“已经tz感知”错误

1 个答案: