读取h5文件失败

Question

我正在尝试使用h5py在ec2（ubuntu）上读取h5文件（使用gzip压缩）。我尝试像这样访问文件：

contents = {}
with h5py.File(h5py_file, 'r') as f:
    for key in enumerate f.keys():
        contents[key] = np.array(f.get(key))

然而，这给了我以下错误： IOError: Can't read data (Can't open directory)

代码在我的本地计算机上正常运行。我还检查过我可以正确访问该文件并且它具有正确的权限。我现在认为它可能与压缩有关，但我确实安装了gzip，所以我不确定到底发生了什么。

当我删除转换为np数组时，我没有收到此错误，但我显然无法访问数据..

问题似乎与this one类似，但我没有使用Anaconda，所以我不确定如何解决它。