Question

我尝试使用此代码使用GDCM库读取DICOM文件：

gdcm.ImageReader imagereader = new gdcm.ImageReader();
imagereader.SetFileName(@"E:\sample_success.dcm");
if (!imagereader.Read()) throw new Exception("Cannot read dicom file!");

对于“sample_success.dcm”文件，我可以正常读取文件（sample_success.png）。但是使用“sample_failed.dcm”文件，GDCM会抛出异常，因为它无法读取它。我尝试使用其他DICOM查看器（如Radiant）打开文件，但它确实有效。我的GDCM版本有问题吗？为什么它看不懂呢？

我使用GDCM 2.6.5。请找到两个样本here.

Answer 1

您的文件包含偏移0x1480aa之后的垃圾（二进制0串）（在像素数据属性中的某处）。如果没有正确报告错误，您对工具包的期望是什么？

按照设计，GDCM仍会加载任何可能的内容，直到出错。因此，如果您删除代码中的new Exception，则可以决定（例如）将imagereader.GetFile()传递给gdcm::Writer并将文件重写为干净的DICOM。

作为旁注，我无法访问Radiant软件，但我觉得很奇怪，在这种情况下它并不表示错误。

我已经使用DCMTK和dicom3tools进行了检查，他们都报告了解析问题。

使用gdcm命令行工具，您几乎可以使用以下方法重写文件：

$ gdcmconv -I sample_failed.dcm sample_failed_correct.dcm

由于您的输入数据集无效，GDCM（错误地）相信会看到某个属性，您可以使用以下命令将其删除：

$ gdcmanon --dumb --remove 0,0 sample_failed_correct.dcm sample_failed_correct_clean.dcm

然后：

$ gdcminfo sample_failed_correct.dcm 
MediaStorage is 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.3.1 [Ultrasound Multi-frame Image Storage]
TransferSyntax is 1.2.840.10008.1.2.4.50 [JPEG Baseline (Process 1): Default Transfer Syntax for Lossy JPEG 8 Bit Image Compression]
NumberOfDimensions: 3
Dimensions: (800,600,21)
SamplesPerPixel    :3
BitsAllocated      :8
BitsStored         :8
HighBit            :7
PixelRepresentation:0
ScalarType found   :UINT8
PhotometricInterpretation: YBR_FULL_422
PlanarConfiguration: 0
TransferSyntax: 1.2.840.10008.1.2.4.50
Origin: (0,0,0)
Spacing: (0.0106324,0.0106324,1)
DirectionCosines: (1,0,0,0,1,0)
Rescale Intercept/Slope: (0,1)
Orientation Label: AXIAL

哪个对像素数据中的碎片数有效：

$ gdcmdump sample_failed_correct.dcm | grep Item | grep "ff.d8" | wc
     21     126    2856

GDCM库无法在C＃中读取dicom文件

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