AttributeError：＆＃39;模块＆＃39;对象没有属性＆＃39; graphviz_layout＆＃39;与networkx 1.11

Question

我尝试使用networkx 1.11绘制一些DAG但我遇到了一些错误，这是测试：

import networkx as nx

print nx.__version__

G = nx.DiGraph()
G.add_node(1,level=1)
G.add_node(2,level=2)
G.add_node(3,level=2)
G.add_node(4,level=3)

G.add_edge(1,2)
G.add_edge(1,3)
G.add_edge(2,4)

import pylab as plt
nx.draw_graphviz(G, node_size=1600, cmap=plt.cm.Blues,
                 node_color=range(len(G)),
                 prog='dot')
plt.show()

这里有追溯：

Traceback (most recent call last):
  File "D:\sources\personal\python\framework\stackoverflow\test_dfs.py", line 69, in <module>
    prog='dot')
  File "d:\virtual_envs\py2711\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_pylab.py", line 984, in draw_graphviz
    pos = nx.drawing.graphviz_layout(G, prog)
AttributeError: 'module' object has no attribute 'graphviz_layout'

我使用的是python 2.7.11 x64，networkx 1.11，我已经在PATH中安装了dot $var = "abc@def.org"; $var = preg_replace_callback( '/(.)@(.)/', function($match) { return sprintf("&#%03d;@&#%03d;", ord($match[1]), ord($match[2])); }, $var ); echo $var,"\n"; 。我错过了什么？

一旦有效，我怎么能用以下节点绘制图形：

• 使用白色背景颜色
• 内置标签
• 有导向箭头
• 自动或手动安排好

与下图相似的东西

graphviz-2.38

正如您在该图像中看到的那样，节点非常好地对齐

Answer 1

在更高版本的networkx中，软件包布局已更改。您可以显式导入graphivz_layout函数。

import networkx as nx
import pylab as plt
from networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layout


G = nx.DiGraph()
G.add_node(1,level=1)
G.add_node(2,level=2)
G.add_node(3,level=2)
G.add_node(4,level=3)

G.add_edge(1,2)
G.add_edge(1,3)
G.add_edge(2,4)

nx.draw(G, pos=graphviz_layout(G), node_size=1600, cmap=plt.cm.Blues,
        node_color=range(len(G)),
        prog='dot')
plt.show()