我有networkx v. 2.1
。为了使它与pandas数据帧一起工作,我尝试了以下内容:
pip3
安装,这在标题中生成Atrribute Error
无效,因此已卸载。 python3 setup.py install
”错误说明。
AttributeError:模块'networkx'没有属性'from_pandas_dataframe`
重现错误的步骤:
我使用csv
导入了数据。我这样做是因为我只想从数据集中读取5000行。
x=pd.DataFrame([x for x in rawData[:5000]])
x[:10]
0 1 2
0 228055 231908 1
1 228056 228899 1
2 228050 230029 1
3 228059 230564 1
4 228059 230548 1
5 70175 70227 1
6 89370 236886 1
7 89371 247658 1
8 89371 249558 1
9 89371 175997 1
g_data=G=nx.from_pandas_dataframe(x)
module 'networkx' has no attribute 'from_pandas_dataframe'
我知道我错过了from_pandas_dataframe
,但无法找到安装它的方法。
[m for m in nx.__dir__() if 'pandas' in m]
['from_pandas_adjacency',
'to_pandas_adjacency',
'from_pandas_edgelist',
'to_pandas_edgelist']
答案 0 :(得分:27)
在networkx 2.0中from_pandas_dataframe
已被删除。 (https://networkx.github.io/documentation/stable/release/release_2.0.html)
相反,您可以使用from_pandas_edgelist
然后你会:
g_data=G=nx.from_pandas_edgelist(x, 1, 2, edge_attr=True)
答案 1 :(得分:2)
一个简单的图形:
import pandas as pd
import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
# Build a dataframe with 4 connections
df = pd.DataFrame({'from': \['A', 'B', 'C', 'A'\], 'to': \['D', 'A', 'E', 'C'\]})
# Build your graph
G = nx.from_pandas_edgelist(df, 'from', 'to')
# Plot it
nx.draw(G, with_labels=True)
plt.show()
答案 2 :(得分:-2)
此solution也有帮助:
G = nx.DiGraph()
G.add_weighted_edges_from([tuple(x) for x in x.values])
nx.info(G)
'Name: \nType: DiGraph\nNumber of nodes: 5713\nNumber of edges: 5000\nAverage in degree: 0.8752\nAverage out degree: 0.8752'