快速计算bson文档中的对象数

时间:2016-09-01 19:18:51

标签: python mongodb bson

我想计算存储在mongodb bson文件中的文档数量,而不必通过mongo restore将文件导入数据库。

我能在python中找到的最好的是

bson_doc = open('./archive.bson','rb')
it = bson.decode_file_iter(bson_doc)
total = sum(1 for _ in it)
print(total)

这在理论上有效,但在bson文档较大时实际上很慢。任何人都可以更快速地计算bson文档中的文档数量而不进行完全解码?

我目前正在使用python 2.7和pymongo。 https://api.mongodb.com/python/current/api/bson/index.html

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我手边没有文件可供尝试,但我相信有一种方法 - 如果您手动解析数据。

source for bson.decode_file_iter(没有文档字符串)是这样的:

_UNPACK_INT = struct.Struct("<i").unpack

def decode_file_iter(file_obj, codec_options=DEFAULT_CODEC_OPTIONS):
    while True:
        # Read size of next object.
        size_data = file_obj.read(4)
        if len(size_data) == 0:
            break  # Finished with file normaly.
        elif len(size_data) != 4:
            raise InvalidBSON("cut off in middle of objsize")
        obj_size = _UNPACK_INT(size_data)[0] - 4
        elements = size_data + file_obj.read(obj_size)
        yield _bson_to_dict(elements, codec_options)

我认为,耗时的操作是_bson_to_dict电话 - 你不需要一个。

因此,您只需要读取文件 - 获取具有下一个文档大小的int32值并跳过它。然后计算你遇到过多少文件。

所以,我相信,这个功能应该可以解决问题:

import struct
import os
from bson.errors import InvalidBSON

def count_file_documents(file_obj):
    """Counts how many documents provided BSON file contains"""
    cnt = 0
    while True:
        # Read size of next object.
        size_data = file_obj.read(4)
        if len(size_data) == 0:
            break  # Finished with file normaly.
        elif len(size_data) != 4:
            raise InvalidBSON("cut off in middle of objsize")
        obj_size = struct.Struct("<i").unpack(size_data)[0] - 4
        # Skip the next obj_size bytes
        file_obj.seek(obj_size, os.SEEK_CUR)
        cnt += 1
    return cnt

(我还没有测试过代码。手边没有MongoDB。)