我有一个元素数组(在这个例子中,这些只是整数),使用一些自定义比较器进行比较。在此示例中,我通过定义i SMALLER j
来模拟此比较器,当且仅当scores[i] <= scores[j]
。
我有两种方法:
我按以下方式更新上面的两个结构:
PriorityQueue.poll
和PriorityQueue.offer
,top
。如果新看到的示例比索引top
处的元素更好,则后者由前者替换,并且top
通过迭代遍历数组的所有k个元素来更新。然而,当我测试时,哪种方法更快,我发现这是第二种。问题是:
- 我使用
PriorityQueue
次优?- 计算k个最小元素的最快方法是什么?
我对这种情况感兴趣,当例子的数量可以很大,但是邻居的数量相对较小(在10到20之间)。
以下是代码:
public static void main(String[] args) {
long kopica, navadno, sortiranje;
int numTries = 10000;
int numExamples = 1000;
int numNeighbours = 10;
navadno = testSimple(numExamples, numNeighbours, numTries);
kopica = testHeap(numExamples, numNeighbours, numTries);
sortiranje = testSort(numExamples, numNeighbours, numTries, false);
System.out.println(String.format("tries: %d examples: %d neighbours: %d\n time heap[ms]: %d\n time simple[ms]: %d", numTries, numExamples, numNeighbours, kopica, navadno));
}
public static long testHeap(int numberExamples, int numberNeighbours, int numberTries){
Random rnd = new Random(123);
long startTime = System.currentTimeMillis();
for(int iteration = 0; iteration < numberTries; iteration++){
final double[] scores = new double[numberExamples];
for(int i = 0; i < numberExamples; i++){
scores[i] = rnd.nextDouble();
}
PriorityQueue<Integer> myHeap = new PriorityQueue(numberNeighbours, new Comparator<Integer>(){
@Override
public int compare(Integer o1, Integer o2) {
return -Double.compare(scores[o1], scores[o2]);
}
});
int top;
for(int i = 0; i < numberExamples; i++){
if(i < numberNeighbours){
myHeap.offer(i);
} else{
top = myHeap.peek();
if(scores[top] > scores[i]){
myHeap.poll();
myHeap.offer(i);
}
}
}
}
long endTime = System.currentTimeMillis();
return endTime - startTime;
}
public static long testSimple(int numberExamples, int numberNeighbours, int numberTries){
Random rnd = new Random(123);
long startTime = System.currentTimeMillis();
for(int iteration = 0; iteration < numberTries; iteration++){
final double[] scores = new double[numberExamples];
for(int i = 0; i < numberExamples; i++){
scores[i] = rnd.nextDouble();
}
int[] candidates = new int[numberNeighbours];
int top = 0;
for(int i = 0; i < numberExamples; i++){
if(i < numberNeighbours){
candidates[i] = i;
if(scores[candidates[top]] < scores[candidates[i]]) top = i;
} else{
if(scores[candidates[top]] > scores[i]){
candidates[top] = i;
top = 0;
for(int j = 1; j < numberNeighbours; j++){
if(scores[candidates[top]] < scores[candidates[j]]) top = j;
}
}
}
}
}
long endTime = System.currentTimeMillis();
return endTime - startTime;
}
这会产生以下结果:
tries: 10000 examples: 1000 neighbours: 10
time heap[ms]: 393
time simple[ms]: 388
答案 0 :(得分:3)
创建最快的算法绝非易事,您需要考虑很多事情。例如,k元素需要返回排序与否,您的研究需要stable(如果两个元素等于你需要在第一个之前提取或不需要)或不是?
在本次竞赛中,理论上最好的解决方案是将k个最小元素保存在有序数据结构中。因为插入可能经常发生在这个数据结构的中间,所以平衡的排序树似乎是一个最佳解决方案。
但现实与此截然不同。
根据原始数组的大小和k的值,不同数据结构之间的混合可能是最佳解决方案:
这种算法名为hibryd algorithm。一个着名的混合算法是Tim Sort,它在java类中用于对集合进行排序。
注意:如果可以使用多线程不同的算法,那么可以使用不同的数据结构。
关于微观基准的补充说明。您的绩效指标会受到与算法效率无关的外部因素的强烈影响。像在两个函数中一样创建对象时,可能需要不可用的内存,要求GC完成额外的工作。这种因素对你的结果影响很大。至少尝试最小化与要调查的代码部分不紧密相关的代码。以不同的顺序重复测试,在调用测试之前等待,以确保没有GC正在运行。
答案 1 :(得分:1)
第一个解决方案的时间复杂度为O(numberExamples * log numberNeighbours)
,而第二个解决方案为O(numberExamples * numberNeighbours)
,因此对于足够大的输入,它必须更慢。第二种解决方案更快,因为您测试小numberNeighbours
,并且PriorityQueue比简单数组具有更大的开销。
您使用PriorityQueue最佳。
更快,但不是最优,只是对数组进行排序,然后最小元素位于k位置。
无论如何,你可能想要实现QuickSelect算法,如果你聪明地选择pivot元素,你应该有更好的性能。您可能希望看到此https://discuss.leetcode.com/topic/55501/2ms-java-quick-select-only-2-points-to-mention
答案 2 :(得分:1)
首先,您的基准测试方法不正确。您正在测量输入数据创建以及算法性能,并且您在测量之前没有预热JVM。通过JMH测试代码的结果:
Benchmark Mode Cnt Score Error Units
CounterBenchmark.testHeap thrpt 2 18103,296 ops/s
CounterBenchmark.testSimple thrpt 2 59490,384 ops/s
修改后的基准pastebin。
关于两个提供的解决方案之间的3倍差异。在big-O表示法方面,你的第一个算法可能看起来更好,但实际上big-O表示法只能告诉你算法在缩放方面有多好,它从不告诉你它的执行速度有多快(见{{3也)。在您的情况下,缩放不是问题,因为您的numNeighbours
限制为20.换句话说,big-O表示法描述了完成算法需要多少滴答,但它并不限制持续时间一个滴答声,它只是说当输入变化时,滴答持续时间不会改变。就嘀嗒复杂度而言,你的第二个算法肯定会获胜。
计算k个最小元素的最快方法是什么?
我想出了下一个解决方案,我相信它允许question完成它的工作:
@Benchmark
public void testModified(Blackhole bh) {
final double[] scores = sampleData;
int[] candidates = new int[numberNeighbours];
for (int i = 0; i < numberNeighbours; i++) {
candidates[i] = i;
}
// sorting candidates so scores[candidates[0]] is the largest
for (int i = 0; i < numberNeighbours; i++) {
for (int j = i+1; j < numberNeighbours; j++) {
if (scores[candidates[i]] < scores[candidates[j]]) {
int temp = candidates[i];
candidates[i] = candidates[j];
candidates[j] = temp;
}
}
}
// processing other scores, while keeping candidates array sorted in the descending order
for (int i = numberNeighbours; i < numberExamples; i++) {
if (scores[i] > scores[candidates[0]]) {
continue;
}
// moving all larger candidates to the left, to keep the array sorted
int j; // here the branch prediction should kick-in
for (j = 1; j < numberNeighbours && scores[i] < scores[candidates[j]]; j++) {
candidates[j - 1] = candidates[j];
}
// inserting the new item
candidates[j - 1] = i;
}
bh.consume(candidates);
}
基准测试结果(比当前解决方案快2倍):
(10 neighbours) CounterBenchmark.testModified thrpt 2 136492,151 ops/s
(20 neighbours) CounterBenchmark.testModified thrpt 2 118395,598 ops/s
其他人提到了branch prediction,但正如人们所预料的那样,该算法的复杂性忽略了它在你的情况下的强势:
@Benchmark
public void testQuickSelect(Blackhole bh) {
final int[] candidates = new int[sampleData.length];
for (int i = 0; i < candidates.length; i++) {
candidates[i] = i;
}
final int[] resultIndices = new int[numberNeighbours];
int neighboursToAdd = numberNeighbours;
int left = 0;
int right = candidates.length - 1;
while (neighboursToAdd > 0) {
int partitionIndex = partition(candidates, left, right);
int smallerItemsPartitioned = partitionIndex - left;
if (smallerItemsPartitioned <= neighboursToAdd) {
while (left < partitionIndex) {
resultIndices[numberNeighbours - neighboursToAdd--] = candidates[left++];
}
} else {
right = partitionIndex - 1;
}
}
bh.consume(resultIndices);
}
private int partition(int[] locations, int left, int right) {
final int pivotIndex = ThreadLocalRandom.current().nextInt(left, right + 1);
final double pivotValue = sampleData[locations[pivotIndex]];
int storeIndex = left;
for (int i = left; i <= right; i++) {
if (sampleData[locations[i]] <= pivotValue) {
final int temp = locations[storeIndex];
locations[storeIndex] = locations[i];
locations[i] = temp;
storeIndex++;
}
}
return storeIndex;
}
在这种情况下,基准测试结果非常令人沮丧:
CounterBenchmark.testQuickSelect thrpt 2 11586,761 ops/s