我有一个数据集,我在其中执行主成分分析(PCA)。我尝试转换数据时收到ValueError
消息。以下是一些代码:
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib as mpl
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.decomposition import PCA as sklearnPCA
data = pd.read_csv('test.csv',header=0)
X = data.ix[:,0:1000].values # values of 1000 predictor variables
Y = data.ix[:,1000].values # values of binary outcome variable
sklearn_pca = sklearnPCA(n_components=2)
X_std = StandardScaler().fit_transform(X)
我在这里收到以下错误消息:
ValueError: Input contains NaN, infinity or a value too large for dtype('float64').
然后我检查原始数据集是否有任何NaN值:
print(data.isnull().values.any()) # prints True
data.fillna(0) # replace NaN values with 0
print(data.isnull().values.any()) # prints True
即使我将NaN值替换为0,我也不明白为什么data.isnull().values.any()
仍在打印True
。
答案 0 :(得分:6)
有两种方法可以实现,尝试替换:
data.fillna(0, inplace=True)
或者,使用返回的对象:
data1 = data.fillna(0)
答案 1 :(得分:2)
您必须使用fillna
小型复制品:
import pandas as pd
data = pd.DataFrame(data=[0,float('nan'),2,3])
print(data.isnull().values.any()) # prints True
data = data.fillna(0) # replace NaN values with 0
print(data.isnull().values.any()) # prints False now :)