将read.csv与R中的符号链接文件一起使用

Question

我正在尝试做什么

我的源文件非常大，我想避免将其复制到其他文件夹中。我决定为大文件创建一个符号链接，并希望使用read.csv来读取文件。

文件夹结构
- project1 / data / source-file.csv
- project2 / data / alias-to-source-file.csv

错在哪里

读取源文件非常有效，但是当我尝试读取符号链接时，我收到以下错误：line 1 appears to contain embedded nulls。

我知道我可以复制文件并将其放入我的第二个项目文件夹中，但我想知道是否有办法使用符号链接。如果没有，我想知道避免在许多项目中复制数据文件的好方法。

提前致谢。

Answer 1

符号链接在我的系统上正确使用时可以正常工作。

> read.csv("foo.csv")
  X1 X2 X3
1  3  4  5
2  5  6  7
> system("ln -s foo.csv bar.csv")
> read.csv("bar.csv")
  X1 X2 X3
1  3  4  5
2  5  6  7

错误的符号链接可能会产生错误，但我无法复制您的错误：

符号链接到不存在的文件：

> system("ln -s nonsuch.csv baz.csv")
> read.csv("baz.csv")
Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "rt") : cannot open file 'baz.csv': No such file or directory

链接到现有目录文件夹：

> system("ln -s / qux.csv")
> read.csv("qux.csv")
Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote,  : 
  no lines available in input