我曾经和R一起工作并且非常喜欢dplyr软件包,您可以轻松地将其分组并进行总结。
但是,在pandas中,我没有看到相当于总结的内容,这就是我在Python中实现它的方式:
import pandas as pd
data = pd.DataFrame(
{'col1':[1,1,1,1,1,2,2,2,2,2],
'col2':[1,2,3,4,5,6,7,8,9,0],
'col3':[-1,-2,-3,-4,-5,-6,-7,-8,-9,0]
}
)
result = []
for k,v in data.groupby('col1'):
result.append([k, max(v['col2']), min(v['col3'])])
print pd.DataFrame(result, columns=['col1', 'col2_agg', 'col3_agg'])
它不仅非常冗长,而且可能不是最优化和最有效的。 (我曾经将for loop groupby
实现重写为groupby.agg
,性能提升很大。
在R中,代码将是
data %>% groupby(col1) %>% summarize(col2_agg=max(col2), col3_agg=min(col3))
在Python或for循环中是否存在有效的等价物是我必须使用的。
另外,@ yayhan真的给了我答案的解决方案,这是一个后续问题,我将在这里列出而不是评论:
等同于groupby().summarize(newcolumn=max(col2 * col3))
答案 0 :(得分:43)
相当于
df %>% groupby(col1) %>% summarize(col2_agg=max(col2), col3_agg=min(col3))
是
df.groupby('col1').agg({'col2': 'max', 'col3': 'min'})
返回
col2 col3
col1
1 5 -5
2 9 -9
返回的对象是一个pandas.DataFrame,其索引名为col1
,列名为col2
和col3
。默认情况下,对数据进行分组时,pandas会将分组列设置为有效访问和修改的索引。但是,如果您不希望这样,则有两种方法可以将col1
设置为列。
通过as_index=False
:
df.groupby('col1', as_index=False).agg({'col2': 'max', 'col3': 'min'})
致电reset_index
:
df.groupby('col1').agg({'col2': 'max', 'col3': 'min'}).reset_index()
都屈服
col1 col2 col3
1 5 -5
2 9 -9
您还可以将多个功能传递给groupby.agg
。
agg_df = df.groupby('col1').agg({'col2': ['max', 'min', 'std'],
'col3': ['size', 'std', 'mean', 'max']})
这也返回一个DataFrame,但现在它有一个MultiIndex列。
col2 col3
max min std size std mean max
col1
1 5 1 1.581139 5 1.581139 -3 -1
2 9 0 3.535534 5 3.535534 -6 0
MultiIndex非常便于选择和分组。以下是一些例子:
agg_df['col2'] # select the second column
max min std
col1
1 5 1 1.581139
2 9 0 3.535534
agg_df[('col2', 'max')] # select the maximum of the second column
Out:
col1
1 5
2 9
Name: (col2, max), dtype: int64
agg_df.xs('max', axis=1, level=1) # select the maximum of all columns
Out:
col2 col3
col1
1 5 -1
2 9 0
早些时候(在version 0.20.0之前),可以使用词典重命名agg
调用中的列。例如
df.groupby('col1')['col2'].agg({'max_col2': 'max'})
会将第二列的最大值返回为max_col2
:
max_col2
col1
1 5
2 9
但是,它被弃用以支持重命名方法:
df.groupby('col1')['col2'].agg(['max']).rename(columns={'max': 'col2_max'})
col2_max
col1
1 5
2 9
对于像上面定义的agg_df
这样的DataFrame,它可能会变得冗长。在这种情况下,您可以使用重命名功能展平这些级别:
agg_df.columns = ['_'.join(col) for col in agg_df.columns]
col2_max col2_min col2_std col3_size col3_std col3_mean col3_max
col1
1 5 1 1.581139 5 1.581139 -3 -1
2 9 0 3.535534 5 3.535534 -6 0
对于groupby().summarize(newcolumn=max(col2 * col3))
之类的操作,您仍然可以首先使用assign
添加新列来使用agg。
df.assign(new_col=df.eval('col2 * col3')).groupby('col1').agg('max')
col2 col3 new_col
col1
1 5 -1 -1
2 9 0 0
这将返回旧列和新列的最大值,但一如既往,您可以对其进行切片。
df.assign(new_col=df.eval('col2 * col3')).groupby('col1')['new_col'].agg('max')
col1
1 -1
2 0
Name: new_col, dtype: int64
groupby.apply
这会更短:
df.groupby('col1').apply(lambda x: (x.col2 * x.col3).max())
col1
1 -1
2 0
dtype: int64
但是,groupby.apply
将此视为自定义函数,因此不会向量化。到目前为止,我们传递给agg
的函数('min','max','min','size'等)是矢量化的,这些是这些优化函数的别名。您可以将df.groupby('col1').agg('min')
替换为df.groupby('col1').agg(min)
,df.groupby('col1').agg(np.min)
或df.groupby('col1').min()
,它们都将执行相同的功能。使用自定义函数时,您将看不到相同的效率。
最后,从版本0.20开始,agg
可以直接在DataFrame上使用,而不必先进行分组。请参阅示例here。
答案 1 :(得分:1)
检查Pandas文档给出的并排比较:http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/comparison_with_r.html#grouping-and-summarizing
R's dplyr
gdf <- group_by(df, col1)
summarise(gdf, avg=mean(col1, na.rm=TRUE))
熊猫
gdf = df.groupby('col1')
df.groupby('col1').agg({'col1': 'mean'})
答案 2 :(得分:0)
使用 datar
将您的 R 代码转换为 python 代码非常容易:
>>> from datar import f
>>> from datar.tibble import tibble
>>> from datar.dplyr import group_by, summarize
>>> from datar.base import min, max
>>> data = tibble(
... col1=[1,1,1,1,1,2,2,2,2,2],
... col2=[1,2,3,4,5,6,7,8,9,0],
... col3=[-1,-2,-3,-4,-5,-6,-7,-8,-9,0]
... )
>>> data >> group_by(f.col1) >> summarize(col2_agg=max(f.col2), col3_agg=min(f.col3))
col1 col2_agg col3_agg
0 1 5 -5
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