在summarize(...)
中(或在do(...)
中创建多个列的最佳方法是什么?如果某些聚合函数返回多个值,则会出现这种情况。这种功能的一个示例是quantile(...)
。
例如,假设我们有以下数据
library(dplyr)
data.frame(x = runif(1000, min = 0, max = 20)) %>%
mutate(y = rnorm(n(), mean = sin(x))) %>%
group_by(x.category = round(x)) ->
Z
我们可以轻松计算(并绘制)分位数:
library(ggplot2) # just to display results (not the focus of this question)
Z %>%
summarize(x = mean(x),
y25 = quantile(y, probs = .25),
y50 = quantile(y, probs = .5),
y75 = quantile(y, probs = .75)) %>%
gather(Statistic, y, -x, -x.category) %>%
ggplot(aes(x, y, color = Statistic)) +
geom_line()
但是,上面的代码有两个缺点:1)quantile(...)
代码必须重复(如果需要十几个分位数,这将变得更加乏味),以及2)列名(y25, y50,y75)可能与实际分位数不符。
这些问题可以通过利用quantile(...)
来计算多个分位数并将其返回到具有名称的向量中的能力来解决,如下所示:
Z %>%
do(as_data_frame(c(x = mean(.$x),
as.list(quantile(.$y, probs = c(.25,.5,.75)))))) %>%
gather(Statistic, y, -x, -x.category) %>%
ggplot(aes(x, y, color = Statistic)) +
geom_line()
但是,上面的代码对我来说似乎很丑陋;特别是,它需要as.list(...)
,c(...)
,as_data_frame(...)
和do(...)
才能做起来很简单。
有更好的方法吗?
答案 0 :(得分:2)
处理返回多个值的函数时,一种可能的方法是通过组合这些值来创建一个字符串,然后使用相应的名称将该字符串分成多个列。
library(dplyr)
library(tidyr)
data.frame(x = runif(1000, min = 0, max = 20)) %>%
mutate(y = rnorm(n(), mean = sin(x))) %>%
group_by(x.category = round(x)) ->
Z
# specify quantiles
q = c(0.25, 0.5, 0.75)
Z %>%
summarise(x = mean(x),
qtls = paste(quantile(y, q), collapse = ",")) %>% # get quantile values as a string
separate(qtls, paste0("y_", 100*q), sep = ",", convert = T) # separate quantile values and give corresponding names to columns
# # A tibble: 21 x 5
# x.category x y_25 y_50 y_75
# <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
# 1 0 0.252 -0.596 0.156 0.977
# 2 1 0.929 -0.191 0.753 1.15
# 3 2 2.07 0.222 0.787 1.26
# 4 3 2.95 -0.488 0.303 1.13
# 5 4 3.92 -1.38 -0.627 -0.0220
# 6 5 4.94 -1.52 -1.08 -0.489
# 7 6 6.03 -0.950 -0.432 0.492
# 8 7 6.97 -0.103 0.602 1.32
# 9 8 7.94 0.350 1.02 1.88
# 10 9 9.00 -0.155 0.393 1.02
# # ... with 11 more rows
答案 1 :(得分:1)
受the answer of @AntoniosK的启发,这里提供了一种解决方案,该解决方案也将多个数字放在单个列中,但不是将它们转换为字符串,而是将它们存储在列表列中:
probs <- c(0.25, 0.5, 0.75)
Z %>%
summarize(x = mean(x),
quantile = list(quantile(y, probs)),
prob = list(probs)) %>%
unnest()
要将结果转换为较宽的格式,可以按照上面的%>% mutate(prob = sprintf('%g%%', 100*prob)) %>% spread(prob, quantile)
(通常)进行操作。
我注意到的一件事是unnest(...)
忽略了向量上的名称。 (实际上,我希望.id
参数可以让我利用它,但是它会在 list 上查找名称,而不是列表中的向量)。如果您真的想使用这些名称,一种方法是:
library(tibble)
Z %>%
summarize(x = mean(x),
quantile = list(enframe(quantile(y)))) %>%
unnest()
使用tibble::enframe(...)
将名称捕获到小标题栏中。
答案 2 :(得分:0)
例如,您可以使用Apply系列:
Z %>%
sapply(function(x){c(quantile(x, probs = (0:10)/10), mean = mean(x))}) %>%
data.frame()
# x x.1 y x.category
# 0% 0.001726993 0.00274735 -4.04157670 0.000
# 10% 1.495121921 2.11284993 -1.51783484 1.000
# 20% 3.450423732 4.23374999 -0.92207407 3.000
# 30% 5.366798687 6.13729078 -0.55590328 5.000
# 40% 7.424445083 8.00006315 -0.18782436 7.000
# 50% 9.607056717 10.01599003 0.09847098 10.000
# 60% 11.605829581 11.98377222 0.39765998 12.000
# 70% 13.402578154 13.95268995 0.75339699 13.000
# 80% 15.432076896 16.04652040 1.16335283 15.000
# 90% 17.759217854 17.90820096 1.64737747 18.000
# 100% 19.991569165 19.97475065 3.33769925 20.000
# mean 9.544870438 10.02387573 0.08833454 9.551