在摘要中创建多个列

时间:2018-06-27 13:18:08

标签: r dplyr

summarize(...)中(或在do(...)中创建多个列的最佳方法是什么?如果某些聚合函数返回多个值,则会出现这种情况。这种功能的一个示例是quantile(...)

例如,假设我们有以下数据

library(dplyr)

data.frame(x = runif(1000, min = 0, max = 20)) %>%
  mutate(y = rnorm(n(), mean = sin(x))) %>%
  group_by(x.category = round(x)) ->
  Z

我们可以轻松计算(并绘制)分位数:

library(ggplot2) # just to display results (not the focus of this question)

Z %>%
  summarize(x = mean(x),
            y25 = quantile(y, probs = .25),
            y50 = quantile(y, probs = .5),
            y75 = quantile(y, probs = .75)) %>%
  gather(Statistic, y, -x, -x.category) %>%
  ggplot(aes(x, y, color = Statistic)) +
  geom_line()

但是,上面的代码有两个缺点:1)quantile(...)代码必须重复(如果需要十几个分位数,这将变得更加乏味),以及2)列名(y25, y50,y75)可能与实际分位数不符。

这些问题可以通过利用quantile(...)来计算多个分位数并将其返回到具有名称的向量中的能力来解决,如下所示:

Z %>%
  do(as_data_frame(c(x = mean(.$x),
                     as.list(quantile(.$y, probs = c(.25,.5,.75)))))) %>%
  gather(Statistic, y, -x, -x.category) %>%
  ggplot(aes(x, y, color = Statistic)) +
  geom_line()

但是,上面的代码对我来说似乎很丑陋;特别是,它需要as.list(...)c(...)as_data_frame(...)do(...)才能做起来很简单。

有更好的方法吗?

3 个答案:

答案 0 :(得分:2)

处理返回多个值的函数时,一种可能的方法是通过组合这些值来创建一个字符串,然后使用相应的名称将该字符串分成多个列。

library(dplyr)
library(tidyr)

data.frame(x = runif(1000, min = 0, max = 20)) %>%
  mutate(y = rnorm(n(), mean = sin(x))) %>%
  group_by(x.category = round(x)) ->
  Z

# specify quantiles
q = c(0.25, 0.5, 0.75)

Z %>%
  summarise(x = mean(x),
            qtls = paste(quantile(y, q), collapse = ",")) %>%   # get quantile values as a string
  separate(qtls, paste0("y_", 100*q), sep = ",", convert = T)   # separate quantile values and give corresponding names to columns

# # A tibble: 21 x 5
#   x.category     x   y_25   y_50    y_75
#        <dbl> <dbl>  <dbl>  <dbl>   <dbl>
# 1          0 0.252 -0.596  0.156  0.977 
# 2          1 0.929 -0.191  0.753  1.15  
# 3          2 2.07   0.222  0.787  1.26  
# 4          3 2.95  -0.488  0.303  1.13  
# 5          4 3.92  -1.38  -0.627 -0.0220
# 6          5 4.94  -1.52  -1.08  -0.489 
# 7          6 6.03  -0.950 -0.432  0.492 
# 8          7 6.97  -0.103  0.602  1.32  
# 9          8 7.94   0.350  1.02   1.88  
# 10         9 9.00  -0.155  0.393  1.02  
# # ... with 11 more rows

答案 1 :(得分:1)

the answer of @AntoniosK的启发,这里提供了一种解决方案,该解决方案也将多个数字放在单个列中,但不是将它们转换为字符串,而是将它们存储在列表列中:

probs <- c(0.25, 0.5, 0.75)

Z %>%
  summarize(x = mean(x),
            quantile = list(quantile(y, probs)),
            prob = list(probs)) %>%
  unnest() 

要将结果转换为较宽的格式,可以按照上面的%>% mutate(prob = sprintf('%g%%', 100*prob)) %>% spread(prob, quantile)(通常)进行操作。

我注意到的一件事是unnest(...)忽略了向量上的名称。 (实际上,我希望.id参数可以让我利用它,但是它会在 list 上查找名称,而不是列表中的向量)。如果您真的想使用这些名称,一种方法是:

library(tibble)

Z %>%
  summarize(x = mean(x),
            quantile = list(enframe(quantile(y)))) %>%
  unnest()

使用tibble::enframe(...)将名称捕获到小标题栏中。

答案 2 :(得分:0)

例如,您可以使用Apply系列:

Z %>%
  sapply(function(x){c(quantile(x, probs = (0:10)/10), mean = mean(x))}) %>%
  data.frame()

#                 x         x.1           y x.category
# 0%    0.001726993  0.00274735 -4.04157670      0.000
# 10%   1.495121921  2.11284993 -1.51783484      1.000
# 20%   3.450423732  4.23374999 -0.92207407      3.000
# 30%   5.366798687  6.13729078 -0.55590328      5.000
# 40%   7.424445083  8.00006315 -0.18782436      7.000
# 50%   9.607056717 10.01599003  0.09847098     10.000
# 60%  11.605829581 11.98377222  0.39765998     12.000
# 70%  13.402578154 13.95268995  0.75339699     13.000
# 80%  15.432076896 16.04652040  1.16335283     15.000
# 90%  17.759217854 17.90820096  1.64737747     18.000
# 100% 19.991569165 19.97475065  3.33769925     20.000
# mean  9.544870438 10.02387573  0.08833454      9.551