networkD3与igraph的着色方案

Question

我有一个网络，我用之前的分析描述了每个节点，并按如下方式分配了颜色：

commit

变量＆＃39; node_colors＆＃39;是一个由先前分析制作的矢量，以便颜色与顶点放置/聚类重合。

然而，当我尝试在networkD3中实现个性化着色方案时，我得到一个未使用的参数＆＃39;错误：

git rebase --abort

错误：        警告：forceNetwork中的错误：未使用的参数（colorScale = node_colors）

NetworkD3似乎只是创建它自己的着色方案......所以当我省略参数时：＆＃39; colorScale = node_colors＆＃39;，我得到以下内容：

但是你可以看到颜色与igraph图的颜色没有同步。

有谁知道如何在networkD3

中创建个性化着色方案（包含一系列颜色的矢量）

Answer 1

您可以使用networkD3包附带的JS()函数传递Javascript代码。在Javascript中，您可以使用十六进制代码来指定颜色。这是一个例子：

YourColors <- 'd3.scaleOrdinal().range([ "#FFA500", "#4169E1",  "#32CD32",
                                         "#FFC0CB", "#8A2BE2", "#FF6347"]);'

forceNetwork(Links = data$links, Nodes = data$nodes, 
             Source = 'source', Target = 'target', 
             NodeID = 'value', Nodesize = 'size', Group = "group",
             ######################### 
             colourScale = JS(YourColors), 
             #########################
             zoom = T, legend = T, opacityNoHover = TRUE)

如果要将特定颜色与特定变量绑定，可以使用

    YourColors <- 'd3.scaleOrdinal()
                  .domain(["variable1", "variable2", "variable3"])
                  .range(["#7FFF00", "#A52A2A", "#E6E6FA"])'