一个代码中的多个二项式测试

时间:2016-07-28 10:13:35

标签: r for-loop lapply hypothesis-test

我想使用binom R包(binom.test函数)执行完全二项式测试,以及4个不同数量的成功,具有4个不同的概率值。

我可以单独做到,但我想知道我是否可以只用一个命令编写代码来进行计算(例如lapply,for循环)。

x <- c(68, 69, 70, 75)  #number of successes
p <- c(1/365, 2/365, 3/365, 4/365)  #probability of success
n <- 265 #number of trials

conf.level = 0.95alternative = "two.sided"(结果可以是1或0)。

有什么建议吗?

我试过了:

for (i in 1:4) {
     test[i] <- binom.test(x[i], n, p[i], alternative = "two.sided", conf.level = 0.95)
      }

但不起作用。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

如果您只对结果p值感兴趣,可以执行以下操作:

x <- c(68, 69, 70, 75)  #number of successes
p <- c(1/365, 2/365, 3/365, 4/365)  #probability of success
n <- 265 #number of trials
test <- numeric(4)

for (i in 1:4) {
  test[i] <- binom.test(x[i], n, p[i], alternative = "two.sided", conf.level = 0.95)$p.value
}

test
[1] 6.621447e-111  1.801758e-92  3.467288e-82  2.442975e-81

答案 1 :(得分:1)

使用mapply

mapply(binom.test, x, p, n=n, alternative = "two.sided", conf.level = 0.95, SIMPLIFY = FALSE)

mapply只是在其第一个参数中调用该函数,并在其附加参数和其他命名参数中包含所有值。 (参见mapply函数的帮助)

如果你只想要一个结果字段,你可以像这样调用mapply:

mapply(function(x,p,n, ...){
         binom.test(x, n, p, ...)$p.value
       },
       x, p, n=n, alternative = "two.sided", conf.level = 0.95)