如何作为子序列进行搜索

Question

我想搜索数据库表并返回任何字符串，这是另一个字符串的子序列。

当我想搜索与另一个字符串相同的字符串时，我使用以下内容：

SELECT kmer from data where kmer="ATCG"

假设kmer =“ATCG”，将进行匹配。但是，如果我想搜索一个子序列怎么办？如下所示：

SELECT kmer from data where kmer in "XXATCGXX"

但显然，这种语法不正确。这些字符串是静态的，我无法使用带有LIKE语法的通配符。

要明确，以下任何值都应返回匹配项：

X
XX
XAT
XATC
ATC
TC
GX
CGXX
A
T
C
G

仅举几个例子。这些都是“XXATCGXX”的子序列，那么我可以使用野猫来涵盖所有这些可能性吗？

Answer 1

LIKE通常与左侧的列值一起使用，但正如Colonel Thirty Two所述，您可以反转比较：

SELECT kmer FROM data WHERE 'XXATCGXX' LIKE '%' || kmer || '%';