如何在python numpy中创建随机正交矩阵

时间:2016-07-17 22:01:24

标签: python numpy linear-algebra orthogonal

有没有一种方法可以调用在python中创建随机正交矩阵?可能使用numpy?或者有没有办法使用多个numpy方法创建一个正交矩阵?感谢。

7 个答案:

答案 0 :(得分:22)

scipy版本0.18有scipy.stats.ortho_groupscipy.stats.special_ortho_group。添加它的拉取请求是https://github.com/scipy/scipy/pull/5622

例如,

In [24]: from scipy.stats import ortho_group  # Requires version 0.18 of scipy

In [25]: m = ortho_group.rvs(dim=3)

In [26]: m
Out[26]: 
array([[-0.23939017,  0.58743526, -0.77305379],
       [ 0.81921268, -0.30515101, -0.48556508],
       [-0.52113619, -0.74953498, -0.40818426]])

In [27]: np.set_printoptions(suppress=True)

In [28]: m.dot(m.T)
Out[28]: 
array([[ 1.,  0., -0.],
       [ 0.,  1.,  0.],
       [-0.,  0.,  1.]])

答案 1 :(得分:14)

您可以通过执行n x n Q因子分解来获得随机n x n正交矩阵QR,(均匀分布在n x n正交矩阵的流形上)带有元素iid的矩阵平均0和方差1的高斯随机变量。这是一个例子:

import numpy as np
from scipy.linalg import qr

n = 3
H = np.random.randn(n, n)
Q, R = qr(H)

print (Q.dot(Q.T))
[[  1.00000000e+00  -2.77555756e-17   2.49800181e-16]
 [ -2.77555756e-17   1.00000000e+00  -1.38777878e-17]
 [  2.49800181e-16  -1.38777878e-17   1.00000000e+00]]

编辑:(在@g g的评论之后重新回答这个答案。)上述关于高斯矩阵的QR分解的索赔,提供了均匀分布(在所谓的Stiefel流形上)正交矩阵,由理论2.3提出。 this reference的.18-19。请注意,结果陈述表明" QR-like"然而,分解,三角矩阵R具有正元素

显然,scipy(numpy)函数qr函数不能保证R 的正对角元素,而相应的Q实际上是均匀分布。这在this专着,Sec。 4.6(讨论涉及MATLAB,但我想MATLAB和scipy都使用相同的LAPACK例程)。建议由Q提供的矩阵qr通过将其与随机酉对角矩阵相乘来修改。

下面我在上面的参考文献中重现了实验,绘制了" direct"的特征值的相位的经验分布(直方图)。由Q提供的qr矩阵,以及"已修改的"}版本,其中可以看出修改后的版本确实具有统一的特征值相位,正如从均匀分布的正交矩阵所预期的那样。

from scipy.linalg import qr, eigvals
from seaborn import distplot

n = 50
repeats = 10000

angles = []
angles_modified = []
for rp in range(repeats):
    H = np.random.randn(n, n)
    Q, R = qr(H)
    angles.append(np.angle(eigvals(Q)))
    Q_modified = Q @ np.diag(np.exp(1j * np.pi * 2 * np.random.rand(n)))
    angles_modified.append(np.angle(eigvals(Q_modified))) 

fig, ax = plt.subplots(1,2, figsize = (10,3))
distplot(np.asarray(angles).flatten(),kde = False, hist_kws=dict(edgecolor="k", linewidth=2), ax= ax[0])
ax[0].set(xlabel='phase', title='direct')
distplot(np.asarray(angles_modified).flatten(),kde = False, hist_kws=dict(edgecolor="k", linewidth=2), ax= ax[1])
ax[1].set(xlabel='phase', title='modified');

enter image description here

答案 2 :(得分:10)

这是从https://github.com/scipy/scipy/pull/5622/files中提取的rvs方法,只有极小的变化 - 足以作为一个独立的numpy函数运行。

import numpy as np    

def rvs(dim=3):
     random_state = np.random
     H = np.eye(dim)
     D = np.ones((dim,))
     for n in range(1, dim):
         x = random_state.normal(size=(dim-n+1,))
         D[n-1] = np.sign(x[0])
         x[0] -= D[n-1]*np.sqrt((x*x).sum())
         # Householder transformation
         Hx = (np.eye(dim-n+1) - 2.*np.outer(x, x)/(x*x).sum())
         mat = np.eye(dim)
         mat[n-1:, n-1:] = Hx
         H = np.dot(H, mat)
         # Fix the last sign such that the determinant is 1
     D[-1] = (-1)**(1-(dim % 2))*D.prod()
     # Equivalent to np.dot(np.diag(D), H) but faster, apparently
     H = (D*H.T).T
     return H

它符合Warren的测试https://stackoverflow.com/a/38426572/901925

答案 3 :(得分:3)

如果你想要一个具有正交列向量的无方阵,你可以使用任何提到的方法创建一个方形矩阵并删除一些列。

答案 4 :(得分:1)

from scipy.stats import special_ortho_group
num_dim=3
x = special_ortho_group.rvs(num_dim)

Documentation

答案 5 :(得分:0)

创建任何形状(n x m)正交矩阵的简单方法:

import numpy as np

n, m = 3, 5

H = np.random.rand(n, m)
u, s, vh = np.linalg.svd(H, full_matrices=False)
mat = u @ vh

print(mat @ mat.T) # -> eye(n)

请注意,如果使用n > m,它将获得mat.T @ mat = eye(m)

答案 6 :(得分:0)

Numpy 也有 qr 分解。 https://numpy.org/doc/stable/reference/generated/numpy.linalg.qr.html

import numpy as np

a = np.random.rand(3, 3)
q, r = np.linalg.qr(a)

q @ q.T
# array([[ 1.00000000e+00,  8.83206468e-17,  2.69154044e-16],
#        [ 8.83206468e-17,  1.00000000e+00, -1.30466244e-16],
#        [ 2.69154044e-16, -1.30466244e-16,  1.00000000e+00]])