向scipy.optimize.curve_fit添加约束?

时间:2016-07-12 23:40:00

标签: python numpy scipy curve-fitting

我可以选择将边界添加到sio.curve_fit。有没有办法扩展这个涉及参数功能的边界特征?换句话说,假设我有一个具有两个或更多未知常数的任意函数。然后我们也说我知道所有这些常量的总和小于10.有没有办法可以实现最后一个约束?

import numpy as np
import scipy.optimize as sio
def f(x, a, b, c):
    return a*x**2 + b*x + c

x = np.linspace(0, 100, 101)
y = 2*x**2 + 3*x + 4

popt, pcov = sio.curve_fit(f, x, y, \
     bounds = [(0, 0, 0), (10 - b - c, 10 - a - c, 10 - a - b)]) # a + b + c < 10

现在,这显然是错误的,但我认为有助于明确这一点。有没有办法可以将参数的约束函数合并到曲线拟合中?

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

使用lmfit,您可以定义4个参数(abcdelta)。 ab可以自由变化。允许delta变化,但最大值为10表示不平等。 c将被限制为delta-a-b(因此,仍有3个变量:c会有所不同,但不会独立于其他变量。如果需要,您还可以对abc的值设置边界。如果不进行测试,您的代码将大致为::

import numpy as np
from lmfit import Model, Parameters

def f(x, a, b, c):
    return a*x**2 + b*x + c

x = np.linspace(0, 100.0, 101)
y = 2*x**2 + 3*x + 4.0

fmodel = Model(f)
params = Parameters()
params.add('a', value=1, vary=True)
params.add('b', value=4, vary=True)
params.add('delta', value=5, vary=True, max=10)
params.add('c', expr = 'delta - a - b')

result = fmodel.fit(y, params, x=x)
print(result.fit_report())

请注意,如果您实际遇到约束表达式或边界指示参数值的情况,则可能无法估计不确定性。

答案 1 :(得分:0)

curve_fit和least_squares只接受框约束。在scipy.optimize中,SLSQP可以处理更复杂的约束。 对于曲线拟合,你可以看一下lmfit包。