我有ndarray
,由arr
定义,是一个n
维立方体,每个维度的长度为m
。
我希望通过沿维度func
切片并将每个n=0
- 昏暗切片作为函数的输入来执行函数n-1
。
这似乎适用于map()
,但我找不到合适的numpy
变体。 np.vectorise
似乎将n-1
- 张量分割为单个标量条目。 apply_along_axis
或apply_over_axes
似乎也不合适。
我的问题是我需要将任意函数作为输入传递,因此我看不到einsum
可行的解决方案。
numpy
的最佳np.asarray(map(func, arr))
替代方案?我通过以下方式将示例数组arr
定义为4
- dim cube(或4-tensor):
m, n = 3, 4
arr = np.arange(m**n).reshape((m,)*n)
我定义了一个示例函数f
,
def f(x):
"""makes it obvious how the np.ndarray is being passed into the function"""
try: # perform an op using x[0,0,0] which is expected to exist
i = x[0,0,0]
except:
print '\nno element x[0,0,0] in x: \n{}'.format(x)
return np.nan
return x-x+i
此函数的预期结果res
将保持相同的形状,但会满足以下条件:
print all([(res[i] == i*m**(n-1)).all() for i in range(m)])
这适用于默认的map()
函数
res = np.asarray(map(f, a))
print all([(res[i] == i*m**(n-1)).all() for i in range(m)])
True
我希望np.vectorize
的工作方式与map()
相同,但它会在标量条目中起作用:
res = np.vectorize(f)(a)
no element x[0,0,0] in x:
0
...
答案 0 :(得分:2)
鉴于arr
为4d,而您的fn
适用于3d数组,
np.asarray(map(func, arr))
看起来非常合理。我会使用列表理解表单,但这是编程风格的问题
np.asarray([func(i) for i in arr])
for i in arr
遍历arr
的第一维。实际上,它将arr
视为3d数组的列表。然后它将结果列表重新组合成一个4d数组。
np.vectorize
doc可以更明确地说明使用标量的函数。但是,是的,它将值传递为标量。请注意,np.vectorize
没有提供传递迭代轴参数的规定。当你的函数从多个数组中获取值时,它是最有用的,比如
[func(a,b) for a,b in zip(arrA, arrB)]
它概括了zip
所以允许广播。但否则它是一个迭代的解决方案。它对func
的内容一无所知,因此无法加快其通话速度。
np.vectorize
最终会调用np.frompyfunc
,这有点不那么通用会慢一点。但它也将标量传递给了func。
np.apply_along/over_ax(e/i)s
也会迭代一个或多个轴。您可能会发现他们的代码具有指导性,但我同意他们不适用于此。
地图方法的一个变体是分配结果数组和索引:
In [45]: res=np.zeros_like(arr,int)
In [46]: for i in range(arr.shape[0]):
...: res[i,...] = f(arr[i,...])
如果您需要在与第1个轴不同的轴上进行迭代,这可能会更容易。
你需要做自己的时间,看看哪个更快。
========================
使用就地修改对第一维进行迭代的示例:
In [58]: arr.__array_interface__['data'] # data buffer address
Out[58]: (152720784, False)
In [59]: for i,a in enumerate(arr):
...: print(a.__array_interface__['data'])
...: a[0,0,:]=i
...:
(152720784, False) # address of the views (same buffer)
(152720892, False)
(152721000, False)
In [60]: arr
Out[60]:
array([[[[ 0, 0, 0],
[ 3, 4, 5],
[ 6, 7, 8]],
...
[[[ 1, 1, 1],
[30, 31, 32],
...
[[[ 2, 2, 2],
[57, 58, 59],
[60, 61, 62]],
...]]])
当我遍历一个数组时,我得到一个从公共数据缓冲区上的连续点开始的视图。如果我修改视图,如上所述或甚至修改a[:]=...
,我修改原始视图。我不需要写任何东西。但是不要使用a = ....
,它会破坏原始数组的链接。