Question

安装RStudio后，我跑了：

library()

警告讯息：库'/ usr / local / lib / R / site-library'，'usr / lib / R / site-library'不包含包

然后我输入：

.libPaths()

[1] "/home/avalon/R/x86_64-pc-linux-gun-library/3.2"
[2] "/usr/local/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib/R/site-library"
[4] "/usr/lib/R/library"

如何删除[2]和[3]以防止再次出现警告信息？

预期产出：

.libPaths()

[1] "/home/avalon/R/x86_64-pc-linux-gun-library/3.2"
[4] "/usr/lib/R/library"

Answer 1

的Linux

要做的第一件事是阅读其上的联机帮助页（?.libPaths），您将看到：

＆＃39; .libPaths＆＃39;用于获取或设置R知道的库树（因此在查找包时使用）。如果使用参数“new”调用，则库搜索路径将设置为 unique(c(new, .Library.site, .Library)) 中的现有目录，并返回此值。如果没有参数，则返回具有当前活动库树的字符向量。

（重点补充）。这应该让我们想知道.Library.site持有什么。奇怪的是，它拥有全系统（ergo＆＃34; site＆＃34;）库路径，并且应该＃34;永远保持，所以他们总是保持。

进一步说：

＆＃39; .Library.site＆＃39;可以通过环境变量来设置＆＃39; R_LIBS_SITE＆＃39; （作为非空的以分号分隔的库树列表）。

所以修复它的一种方法是在启动R 时给它一个空字符串 （不能在R中完成）：

# in bash on the command line: $ R_LIBS_SITE=" " R # in R R> .libPaths() [1] "/usr/lib/R/library"

使用RStudio实现此功能的方法是创建一个至少包含以下内容的~/.Renviron文件：

R_LIBS_SITE=" "

完成后，您不必再采取任何措施从.libPaths()删除辅助站点库路径：

R> .libPaths() [1] "/usr/lib/R/library"

窗

假设您正在执行以下操作：

R> .libPaths(c("/home/avalon/R/x86_64-pc-linux-gun-library/3.2", .libPaths())) [1] "/home/avalon/R/x86_64-pc-linux-gun-library/3.2" [2] "/usr/local/lib/R/site-library" [3] "/usr/lib/R/site-library" [4] "/usr/lib/R/library"

如果您想在完成此操作后进行更正，请执行以下操作：

R> .libPaths( c(.libPaths()[c(1,4)]) ) [1] "/home/avalon/R/x86_64-pc-linux-gun-library/3.2" [2] "/usr/lib/R/library"

或者，你可以这样做第一次（即，虽然它仍然有三个元素，其中两个对你不好）：

R> .libPaths(c("/home/avalon/R/x86_64-pc-linux-gun-library/3.2", .libPaths()[3])) [1] "/home/avalon/R/x86_64-pc-linux-gun-library/3.2" [2] "/usr/lib/R/library"

当然有一种方法可以通过编程方式过滤路径，而不是盲目地使用第3个元素，但这应该适用于此。

Ubuntu删除R中的.libPaths（）

1 个答案:

的Linux

窗