根据GCC 6.1 manual on Link Options：
-Wl，选项
将选项作为链接器的选项。 如果选项包含逗号，则会在逗号中将其拆分为多个选项。
-Xlinker选项
将选项作为链接器的选项。 您可以使用它来提供GCC无法识别的系统特定的链接器选项。
为什么我们需要2个？
同样，为什么我们需要-Xassembler和-Wa作为汇编程序选项？
引自GCC 6.1 doc on Assembler Options：
-Wa，选项
将选项作为汇编程序的选项。 如果选项包含逗号，则会在逗号中将其拆分为多个选项。
-Xassembler选项
将选项作为汇编程序的选项。 您可以使用它来提供GCC无法识别的特定于系统的汇编程序选项。
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差异在于以下粗体文字
<强> -Wl，选项
传递选项作为链接器的选项。如果选项包含逗号，则会在逗号中将其拆分为多个选项。 您可以使用此语法将参数传递给选项。例如，-Wl，-Map，output.map将-Map output.map传递给链接器。使用GNU链接器时，您也可以使用-Wl，-Map = output.map获得相同的效果。
-Xlinker选项
传递选项作为链接器的选项。您可以使用它来提供GCC无法识别的特定于系统的链接器选项。 如果要传递一个带有单独参数的选项，则必须使用-Xlinker两次，一次用于选项，一次用于参数。例如，要传递-assert定义，您必须编写-Xlinker -assert -Xlinker定义。它不能用于编写-Xlinker＆＃34; -assert definitions＆＃34;，因为这会将整个字符串传递为单个参数，这不是链接器所期望的。
使用GNU链接器时，使用option = value语法而不是单独的参数将参数传递给链接器选项通常更方便。例如，您可以指定-Xlinker -Map = output.map而不是-Xlinker -Map -Xlinker output.map。其他链接器可能不支持命令行选项的此语法。
由于背面兼容性，我猜两个类似的功能仍然存在。