Question

我正在尝试从CSV文件中读取数据帧，并为数据框中的每个列生成散点图。例如，我在FULL_NAME ----------------------- John D Smith Mary Ann Loury Chris Robson III Greg Z. Olson Jr. Helen Webb-Hunt

中阅读了以下内容

df=pandas.readcsv()

我想使用sample作为x值以及每列的区域生成散点图。

我使用以下代码与bokeh.plotting手动绘制每一列

Sample    AMP    ADP    ATP
1A        239847 239084 987374
1B        245098 241210 988950
2A        238759 200554 921032
2B        230029 215408 899804

这会成功生成散点图，但我想创建一个循环来为每列生成散点图。在我的完整数据集中，我想要绘制超过500列。

我已经按照df.iteritems和df.itertuples的参考来迭代数据帧，但我不知道如何获得我想要的输出。

我尝试了以下内容：

import pandas
from bokeh.plotting import figure, show

df = pandas.read_csv("data.csv")
p = figure(x_axis_label='Sample', y_axis_label='Peak Area', x_range=sorted(set(df['Sample'])))
p.scatter(df['Sample'], df['AMP'])
show(p)

我马上发现错误：

引发KeyError（'％s不在索引'％objarr [mask] KeyError：“['1A''1B' '2A''2B']不在索引
中

任何指导？提前谢谢。

Answer 1

iteritems遍历列，而不是行。但是，当您尝试df[row]而不是df[index]时，您的真正问题就在于此。我将措辞切换到列并执行此操作：

for colname, col in df.iteritems():
p = figure()
p.scatter(df['Sample'], df[colname])
show(p)

在pandas数据帧中迭代带有for循环的列

1 个答案: