用R计算拐点

时间:2016-06-30 14:13:06

标签: r

我正在尝试使用“中位数绝对偏差值排序列表的拐点”进行“方差过滤”来重现论文。

到目前为止,我获得了mad的中位数绝对值(MAD :):

mad.v <- apply(x, 2, mad, na.rm = T)
mad.v <- mad[!is.na(mad.v)]

然后我创建一个函数来计算这些值的百分比

count.p <- function(data, per){
  # Calculates the percentatge above some data
  sum(data >= per)/length(data)
}
perc <- unlist(lapply(mad.v, count.p, data = mad.v))

当我绘制它时,我获得了类似的东西:

percentatge over values 垂直蓝线是蓝色趋势的拐点,红色是另一个的拐点。我不太相信,因为在这一点之前,红色趋势已经改变了凹陷。

如何获得拐点?

我已经看过变形包但我不知道如何在上面的图像中正确使用ede那里应该是拐点。我也找到了RootsExtremaInflections包,但我不知道如何正确使用它(我做了:inflexi(mad.v, perc, 3000, 13000, 2, 5, "x", "y", 3,3)

我尝试过的其他事情是另一个question并且自己做secant method函数的衍生物(我不确定如何计算它们)

sampledata <- matrix(rnbinom(5000, 2, 0.5), 10, 500)

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