Question

我正在尝试使用R中的mRMRe包对基因表达数据集进行特征选择。

我的目标变量是一个分类变量，即每个样本都与一个类相关联，该类用作目标变量。

但是，通过使用mRMRe包，我在尝试加载数据时收到以下错误：

data <- mRMR.data(data = data)

Error in .local(.Object, ...): data columns must be either of numeric, ordered factor or Surv type
Traceback:

1. mRMR.data(data = data)
2. new("mRMRe.Data", ...)
3. initialize(value, ...)
4. initialize(value, ...)
5. .local(.Object, ...)
6. stop("data columns must be either of numeric, ordered factor or Surv type")

第一列有分类标签，例如＆＃34; Class1＆＃34;，＆＃34; Class2＆＃34;等。当我使用str(data)时，我得到的第一列是Factor类型。但是，它不能被订购，因为它是绝对的。

mRMRe是否有可能无法处理分类数据？

Answer 1

我收到了开发人员的答复：

目标变量只有在订购时才能分类。在2个类别的情况下，顺序是任意的。对于非逻辑排序的更多类别（多分类分类），mRMRe不适用。

所以在这种情况下我不能使用它，因为我的标签是绝对的。

Answer 2

必须按ordered(data$variable1) str(data)将列转换为有序因子Ord.factor

使用mRMRe将特征选择与分类目标变量一起使用

2 个答案: