我还没有能够为atom.io找到一个包，让你可以为C ++代码编写Doxygen风格的文档。
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有Docblockr Package。 Docblockr在其自述文件中声称支持C ++。
安装：
apm install docblockr
我不得不重新启动Atom，并且Doxygen自动完成功能开始工作。
注意我已经看过PHP类的一些问题，所以YMMV。但是我正在使用Nuclide（构建在Atom之上），并且正在测试PHP类，因此您可能不会遇到同样的问题。
祝你好运！