Xeon Phi:使用填充性能降低

时间:2016-06-06 17:31:53

标签: c openmp compiler-optimization icc xeon-phi

我已经实现了一个简单的n x n矩阵乘法来测试c中与OpenMp相同的性能调整。我的初始代码如下:

#pragma omp parallel for shared(a,b,c) private(h,i,j,k)
    for( i = 0; i < n; i++ )
    {
        for( j = 0; j < n; j++)
        {
            for( k = 0; k < n; k++ )
            {
                a[i*n+j]+= b[i*n+k] * c[k*n+j];

编译器切换j和k循环,所以我得到了ikj-Algorithm。我想要实现的第一件事是填充以将每行对齐到64字节以进行所有对齐的缓存访问。因此,我计算了每行所需的额外大小。行的长度为5900,新的大小为5904(参考号为ISBN-9780124104143)。我的新代码如下:

#pragma omp parallel for shared(a,b,c) private(h,i,j,k)
    for( i = 0; i < n; i++ )
    {
        for( k = 0; k < n; k++ )
        {
            #pragma simd
            #pragma unroll(4)
            for( j = 0; j < n; j++)
            {
                a[i*pn+j]+= b[i*pn+k] * c[k*pn+j];

其中pn是新的填充行长度。我不得不手动置换我的循环,因为编译器拒绝了。在普通的Xeon处理器上运行此代码,我获得了与以前几乎相同的性能,可能会更好一些。这就是我的预期。但是,当我在Xeon Phi上运行代码时,它大约是初始代码的1/10。

经过进一步的编译器调查后,我注意到内循环不再被展开和向量化了。所以我添加了以下#pragmas:

#pragma simd
#pragma unroll

矢量化工作正常,但余数循环没有展开。性能更好,但仍然只是正常版本的1/2左右。

以下是普通代码的编译器(-O3)输出:

  LOOP BEGIN at mm_par.c(75,3)
  remark #25444: Loopnest Interchanged: ( 1 2 3 ) --> ( 1 3 2 )

   LOOP BEGIN at mm_par.c(79,5)
   remark #25460: No loop optimizations reported

    LOOP BEGIN at mm_par.c(77,4)
    remark #15301: PERMUTED LOOP WAS VECTORIZED
    LOOP END

    LOOP BEGIN at mm_par.c(77,4)
    <Remainder>
    remark #25436: completely unrolled by 4  
    LOOP END
   LOOP END
  LOOP END

这里是带有simd和展开pragma的填充的输出:

LOOP BEGIN at mm_ali.c(76,3)
remark #25460: No loop optimizations reported

 LOOP BEGIN at mm_ali.c(78,4)
 remark #25460: No loop optimizations reported

  LOOP BEGIN at mm_ali.c(82,10)
     remark #15301: SIMD LOOP WAS VECTORIZED
  LOOP END
 LOOP END
LOOP END

因此展开会被忽略。有没有办法强迫它?我也质疑自己,如果这是表现糟糕的唯一原因..

编辑: 没有填充的快速矩阵乘法的组合看起来像这样:

 vmovapd   c(%r15,%rbx,8), %zmm1                         #81.28 c1
    vprefetche1 2048+a(%r11,%rbx,8)                         #81.6 c5
    vmovapd   64+c(%r15,%rbx,8), %zmm3                      #81.28 c9
    vprefetch0 768+a(%r11,%rbx,8)                           #81.6 c13
    vmovapd   128+c(%r15,%rbx,8), %zmm4                     #81.28 c17
    vprefetch1 2048+c(%r15,%rbx,8)                          #81.28 c21
    vmovapd   192+c(%r15,%rbx,8), %zmm5                     #81.28 c25
    vprefetch0 768+c(%r15,%rbx,8)                           #81.28 c29
    vfmadd213pd a(%r11,%rbx,8), %zmm0, %zmm1                #81.6 c33
    vprefetche1 2112+a(%r11,%rbx,8)                         #81.6 c37
    vfmadd213pd 64+a(%r11,%rbx,8), %zmm0, %zmm3             #81.6 c41
    vprefetch0 832+a(%r11,%rbx,8)                           #81.6 c45
    vfmadd213pd 128+a(%r11,%rbx,8), %zmm0, %zmm4            #81.6 c49
    vprefetch1 2112+c(%r15,%rbx,8)                          #81.28 c53
    vfmadd213pd 192+a(%r11,%rbx,8), %zmm0, %zmm5            #81.6 c57
    vprefetch0 832+c(%r15,%rbx,8)                           #81.28 c61
    vmovaps   %zmm1, a(%r11,%rbx,8)                         #81.6 c65
    vprefetche1 2176+a(%r11,%rbx,8)                         #81.6 c69
    vmovaps   %zmm3, 64+a(%r11,%rbx,8)                      #81.6 c73
    vprefetch0 896+a(%r11,%rbx,8)                           #81.6 c77
    vmovaps   %zmm4, 128+a(%r11,%rbx,8)                     #81.6 c81
    vprefetch1 2176+c(%r15,%rbx,8)                          #81.28 c85
    vmovaps   %zmm5, 192+a(%r11,%rbx,8)                     #81.6 c89
    vprefetch0 896+c(%r15,%rbx,8)                           #81.28 c93
    vprefetche1 2240+a(%r11,%rbx,8)                         #81.6 c97
    vprefetch0 960+a(%r11,%rbx,8)                           #81.6 c101
    vprefetch1 2240+c(%r15,%rbx,8)                          #81.28 c105
    vprefetch0 960+c(%r15,%rbx,8)                           #81.28 c109
    addq      $32, %rbx                                     #77.4 c113
    cmpq      %rsi, %rbx                                    #77.4 c117
    jb        ..B1.51       # Prob 99%                      #77.4 c117

使用padding缓慢乘法的那个看起来像这样:

vloadunpackld (%rbx), %zmm0                             #83.6 c1
    addl      $32, %r15d                                    #81.10 c1
    vprefetch1 2048+c(%rcx)                                 #83.30 c5
    vloadunpackhd 64(%rbx), %zmm0                           #83.6 c9
    addq      $256, %rbx                                    #81.10 c9
    vprefetch0 512+c(%rcx)                                  #83.30 c13
    vbroadcastsd b(%r12,%r13,8), %zmm2                      #83.18 c17
    vprefetch1 2112+c(%rcx)                                 #83.30 c21
    vfmadd132pd c(%rcx), %zmm0, %zmm2                       #83.6 c25
    vprefetch0 576+c(%rcx)                                  #83.30 c29
    vpackstoreld %zmm2, (%rsi)                              #83.6 c33
    vprefetch1 2176+c(%rcx)                                 #83.30 c37
    vpackstorehd %zmm2, 64(%rsi)                            #83.6 c41
    addq      $256, %rsi                                    #81.10 c41
    vprefetch0 640+c(%rcx)                                  #83.30 c45
    vloadunpackld (%rdi), %zmm3                             #83.6 c49
    vprefetch1 2240+c(%rcx)                                 #83.30 c53
    vloadunpackhd 64(%rdi), %zmm3                           #83.6 c57
    addq      $256, %rdi                                    #81.10 c57
    vprefetch0 704+c(%rcx)                                  #83.30 c61
    vbroadcastsd b(%r12,%r13,8), %zmm4                      #83.18 c65
    vfmadd132pd 64+c(%rcx), %zmm3, %zmm4                    #83.6 c69
    nop                                                     #83.6 c73
    vpackstoreld %zmm4, (%r8)                               #83.6 c77
    vpackstorehd %zmm4, 64(%r8)                             #83.6 c81
    addq      $256, %r8                                     #81.10 c81
    vloadunpackld (%r9), %zmm5                              #83.6 c85
    vloadunpackhd 64(%r9), %zmm5                            #83.6 c89
    addq      $256, %r9                                     #81.10 c89
    vbroadcastsd b(%r12,%r13,8), %zmm6                      #83.18 c93
    vfmadd132pd 128+c(%rcx), %zmm5, %zmm6                   #83.6 c97
    nop                                                     #83.6 c101
    vpackstoreld %zmm6, (%r10)                              #83.6 c105
    vpackstorehd %zmm6, 64(%r10)                            #83.6 c109
    addq      $256, %r10                                    #81.10 c109
    vloadunpackld (%r11), %zmm7                             #83.6 c113
    vloadunpackhd 64(%r11), %zmm7                           #83.6 c117
    addq      $256, %r11                                    #81.10 c117
    vbroadcastsd b(%r12,%r13,8), %zmm8                      #83.18 c121
    vfmadd132pd 192+c(%rcx), %zmm7, %zmm8                   #83.6 c125
    addq      $256, %rcx                                    #81.10 c129
    movb      %al, %al                                      #83.6 c129
    vpackstoreld %zmm8, (%rdx)                              #83.6 c133
    vpackstorehd %zmm8, 64(%rdx)                            #83.6 c137
    addq      $256, %rdx                                    #81.10 c137
    cmpl      $5888, %r15d                                  #81.10 c141
    jb        ..B1.42       # Prob 99%                      #81.10 c141

以下是我的解决方案的完整代码。同样,如果我用n交换np,性能提高两倍以上。

#include <sys/time.h>
#include <omp.h>

#ifndef max
#define max(a,b) (((a) (b)) ? (a) : (b))
#define min(a,b) (((a) < (b)) ? (a) : (b))
#endif

#define n 5900
#define pn ((((n*sizeof(double))+63)/64)*(64/sizeof(double))) //padding
#define threadNum 144
#define loops 1

double dtime()
{
    double tseconds = 0.0;
    struct timeval mytime;
    gettimeofday(&mytime, (struct timezone*)0);
    tseconds = (double)(mytime.tv_sec + mytime.tv_usec*1.0e-6);
    return tseconds;

}

double a[n*pn] __attribute__((aligned(64)));
double b[n*pn] __attribute__((aligned(64)));
double c[n*pn] __attribute__((aligned(64)));


main(int argc, char **argv){

    int threadNumber, loopNumber;
    if(argc == 3) 
    {
        threadNumber = atoi(argv[1]);
        loopNumber = atoi(argv[2]);
    } else 
    {
        threadNumber = threadNum;
        loopNumber = loops;     
    }


    double tstart, tstop, ttime;
    int i,j,k,h;

    // initialize matrices
    #pragma omp parallel for
    for(i = 0; i < pn*n; i++)
    {
        a[i]=0.0;
        b[i]=2.0;
        c[i]=2.0;
    }

    omp_set_num_threads(threadNumber); 

    tstart = dtime();

    //parallelize via OpenMP on MIC
    for(h = 0; h < loopNumber; h++){
        #pragma omp parallel for shared(a,b,c) private(h,i,j,k)
        for( i = 0; i < n; i++ )
        {
            for( k = 0; k < n; k++ )
            {           
                #pragma omp simd aligned( a, b, c: 64 )
                for( j = 0; j < n; j++)             
                {
                    a[i*pn+j]+= b[i*pn+k] * c[k*pn +j];
                }
            }
        }

    }

    tstop = dtime();
    double elapsed = tstop - tstart;

    double mFlops = ((double)n)*n*n*2.0*loopNumber/elapsed*1.0e-06;

    #pragma omp parallel
    #pragma omp master
    printf("%d %.3f\n", omp_get_num_threads(), mFlops);

}

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您提供的代码片段太小而无法进行正确的测试我可以在没有正确测试的情况下建议解决方案,因此可能会失败。无论如何,这里什么都没有。

你说过你填充数据以对齐行,但是,AFAICS,这些信息永远不会传输给编译器,因此编译器无法利用它。为此你有各种解决方案,但由于你已经有OpenMP指令用于并行化,使用更多的矢量化似乎是显而易见的选择。

所以这会给你这样的东西:

#pragma omp parallel for private( i, j, k )
for( i = 0; i < n; i++ ) {
    double *aa = &a[i * pn];
    double *bb = &b[i * pn];
    for( k = 0; k < n; k++ ) {
        double *cc = &c[k * pn];
        #pragma omp simd aligned( aa, bb, cc: 64 )
        for( j = 0; j < n; j++) {
            aa[j] += bb[k] * cc[j];
        }
    }
}

我假设您的数组为double,因此您可能需要更改它们不是。除此之外,我认为这个想法就在那里。我不知道它是否适合你,但这绝对值得一试。