我有一个稀疏矩阵:
from scipy.sparse import csr_matrix
M=csr_matrix((5,5))
M[2,3]=4
我想迭代所有非零条目,例如:
for x,y,v in M.non_zero_entries:
do_something()
我尝试理解M.data
,M.indices
和M.indptr
的价值
现在,在上面的示例中:
print (M.data) #outputs [4]
print (M.indices) #outputs [3]
print (M.indptr) #outputs [0,0,0,1,1,1]
如何从中提取非零记录?
答案 0 :(得分:4)
您可以使用M.tocoo()
返回"坐标格式"矩阵的版本,其中包含您在"显而易见的"中使用的向量data
,row
和col
。方式。
或者你可以手工完成。这样的事情(警告:只测试了一个例子,我没有考虑效率):
def csr_entries(M):
"""Generator of tuples (i,j,x) of sparse matrix entries
meaning that M[i,j]=x."""
for row in range(len(M.indptr)-1):
i,j = M.indptr[row],M.indptr[row+1]
for k in range(i,j):
yield (row, M.indices[k], M.data[k])
答案 1 :(得分:1)
您正在寻找的是nonzero方法:
csr_matrix.nonzero()
返回一个数组(行,列)的元组,其中包含 矩阵的非零元素。
所以您的循环将是这样的:
for row, col in zip(*M.nonzero()):
val = M[row, col]
# do something
print((row, col), val)