使用DTW距离的python中的层次聚类

Question

我正在尝试使用DTW（动态时间扭曲）距离在python中创建层次聚类。我能够使用DTW包计算距离，但不能确保在scipy中为层次聚类提供用户定义的距离。

任何有关如何进行的想法都会有很大的帮助。感谢

Answer 1

请研究scikit learn documentation。

  

亲和力：字符串或可调用，默认：“euclidean”

     

    

用于计算链接的度量标准。可以是“euclidean”，“l1”，“l2”，“manhattan”，“cosine”或“precomputed”。

  

或者，如果您在没有scikit-learn的情况下使用scipy，那么还有documentation。

  

y ：ndarray

     

    

精简或冗余距离矩阵。压缩距离矩阵是包含距离矩阵的上三角形的平面阵列。这是pdist返回的形式。或者，n维的（m）观察向量的集合可以作为（m）乘（n）数组传递。