Question

我是新手，目前正在尝试在R中安装openssl软件包（我有一个SUSE Linux Enterprise服务器SP3发行版），但它失败了。错误消息是这样的：

During startup - Warning message:  
Setting LC_CTYPE failed, using "C"   
* installing *source* package 'openssl' ...  
** package 'openssl' successfully unpacked and MD5 sums checked  
Using PKG_CFLAGS=  
Using PKG_LIBS=-lssl -lcrypto  
------------------------- ANTICONF ERROR ---------------------------  
Configuration failed because openssl was not found. Try installing:    
* deb: libssl-dev (Debian, Ubuntu, etc)  
* rpm: openssl-devel (Fedora, CentOS, RHEL)  
* csw: libssl_dev (Solaris)  
* brew: openssl (Mac OSX)  
If openssl is already installed, check that 'pkg-config' is in your  
PATH and PKG_CONFIG_PATH contains a openssl.pc file. If pig-config  
is unavailable you can set INCLUDE_DIR and LIB_DIR manually via:  
R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=... LIB_DIR=...'  
--------------------------------------------------------------------  
ERROR: configuration failed for package 'openssl'

我确保在SUSE中安装了openssl：

OpenSSL 0.9.8j-fips 07 Jan 2009
built on: Mon May  2 15:55:35 UTC 2016
platform: linux-x86_64
options:  bn(64,64) md2(int) rc4(16x,int) des(idx,cisc,4,long) blowfish(ptr2) 
compiler: gcc -fPIC -DOPENSSL_PIC -DZLIB -DOPENSSL_THREADS -D_REENTRANT -   
DDSO_DLFCN -DHAVE_DLFCN_H -DL_ENDIAN -DMD32_REG_T=int -fmessage-length=0 -O2  
-Wall -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fstack-protector -funwind-tables -fasynchronous-  
unwind-tables -g -fomit-frame-pointer -fno-strict-aliasing -DTERMIO -DPURIFY - 
Wall -fstack-protector -Wa,--noexecstack -fprofile-use  -DOPENSSL_BN_ASM_MONT  
- DSHA1_ASM -DSHA256_ASM -DSHA512_ASM -DMD5_ASM -DAES_ASM
OPENSSLDIR: "/etc/ssl"

openssl.pc文件位于此处：

/home/oscar/anaconda_ete/pkgs/openssl-1.0.2g-0/lib/pkgconfig/openssl.pc
/home/oscar/anaconda_ete/lib/pkgconfig/openssl.pc
/etc/ssl/openssl.pc
/usr/lib64/pkgconfig/openssl.pc

如果您能提供任何帮助，我将非常感激。我已经被困了几天试图解决这个问题没有任何成功。非常感谢。
P.S。：我正在安装这个软件包（openssl），因为它是另一个R软件包（BioGeoBEARS）的要求。

Answer 1

您无法在SLES 11上安装0.9.8以上的新版本，因为下一个openssl版本与其自身不兼容。 https://www.suse.com/communities/blog/tls-1-2/ https://www.openssl.org/news/changelog.html#x37

但是有可能在另一个文件夹中在SLES11上构建和安装openssl 1.0.2并将r-openssl包指向它。

下载并解压缩openssl src tarball

cd ~ curl https://www.openssl.org/source/openssl-1.1.0f.tar.gz | tar zxv

为其他openssl版本创建一个新目录 e.g。

sudo mkdir -p /opt/R/extra/openssl

使用前缀

构建并安装openssl 1.1.0

cd openssl-1.1.0f ./configure --prefix=/opt/R/extra/openssl make sudo make install

安装r-package openssl（0.9.7）

cd ~ R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=/opt/R/extra/openssl/include LIB_DIR=/opt/R/extra/openssl/lib' openssl_0.9.7.tar.gz

在R SUSE中安装openssl失败

1 个答案: