如何创建一个与NumPy ufuncs兼容的类数组类?

时间:2016-05-30 15:56:38

标签: python numpy automatic-differentiation

我正在尝试使用行为类似于NumPy数组的类来实现Automatic Differentiation。它子类numpy.ndarray,但包含两个数组属性。一个用于值,一个用于雅可比矩阵。每个操作都被重载以对值和雅可比行为进行操作。但是,我无法使NumPy ufunc(例如,np.log)在我的自定义“数组”上工作。

我创建了以下最小示例,说明了该问题。 Two应该是NumPy数组的辐射加固版本,它会计算两次,并确保结果相等。

必须支持索引,元素对数和长度。就像普通的ndarray一样。使用x.cos()调用时,元素对数工作正常,但使用np.cos(x)调用时会出现意外情况。

from __future__ import print_function
import numpy as np

class Two(object):
    def __init__(self, val1, val2):
        print("init with", val1, val2)
        assert np.array_equal(val1, val2)
        self.val1 = val1
        self.val2 = val2

    def __getitem__(self, s):
        print("getitem", s, "got", Two(self.val1[s], self.val2[s]))
        return Two(self.val1[s], self.val2[s])

    def __repr__(self):
        return "<<{}, {}>>".format(self.val1, self.val2)

    def log(self):
        print("log", self)
        return Two(np.log(self.val1), np.log(self.val2))

    def __len__(self):
        print("len", self, "=", self.val1.shape[0])
        return self.val1.shape[0]

x = Two(np.array([1,2]).T, np.array([1,2]).T)

索引返回两个属性中的相关元素,如预期的那样:

>>> print("First element in x:", x[0], "\n")
init with [1 2] [1 2]
init with 1 1
getitem 0 got <<1, 1>>
init with 1 1
First element in x: <<1, 1>> 

使用x.cos()

调用元素对数时效果很好
>>> print("--- x.log() ---", x.log(), "\n")
log <<[1 2], [1 2]>>
init with [ 0.  0.69314] [ 0.  0.69314]
--- x.log() --- <<[ 0.  0.69314], [ 0.   0.69314]>> 

但是,np.log(x)无效。它意识到对象有一个长度,所以它提取每个项目并在每个项目上取对数,然后返回一个两个对象的数组(dtype = object)。

>>> print("--- np.log(x) with len ---", np.log(x), "\n") # WTF
len <<[1 2], [1 2]>> = 2
len <<[1 2], [1 2]>> = 2
init with 1 1
getitem 0 got <<1, 1>>
init with 1 1
init with 2 2
getitem 1 got <<2, 2>>
init with 2 2
len <<[1 2], [1 2]>> = 2
len <<[1 2], [1 2]>> = 2
init with 1 1
getitem 0 got <<1, 1>>
init with 1 1
init with 2 2
getitem 1 got <<2, 2>>
init with 2 2
len <<[1 2], [1 2]>> = 2
len <<[1 2], [1 2]>> = 2
init with 1 1
getitem 0 got <<1, 1>>
init with 1 1
init with 2 2
getitem 1 got <<2, 2>>
init with 2 2
log <<1, 1>>
init with 0.0 0.0
log <<2, 2>>
init with 0.693147 0.693147
--- np.log(x) with len --- [<<0.0, 0.0>> <<0.693147, 0.693147>>]

如果Two没有长度方法,它就可以正常工作:

>>> del Two.__len__
>>> print("--- np.log(x) without len ---", np.log(x), "\n")
log <<[1 2], [1 2]>>
init with [ 0.          0.69314718] [ 0.   0.693147]
--- np.log(x) without len --- <<[ 0.   0.693147], [ 0.          0.693147]>>

如何创建满足要求的类(getitem,log,len)?我研究了子类化ndarray,但这似乎比它的价值更复杂。

另外,我在NumPy源代码中找不到访问x.__len__的位置,所以我也对此感兴趣。

编辑:我正在使用miniconda2和Python 2.7.11以及NumPy 1.11.0。

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