汇总数组中的项目 - 在DataFrame中 - 在groupby

时间:2016-05-25 19:55:19

标签: python pandas

我正在研究一些显示主题模型随时间分布的代码。现在,数据框看起来像这样:

doc_id  date        topic_dist
1       2007-01-01  [.2,.5,.3]
2       2007-03-02  [.8,.1,.1]
...

我的目标是按日期(按月,年或季度)对文档进行分组,并对数组中的每个项目进行求和(所有数组的长度相同),以创建类似于以下内容的输出: / p>

month    topic_sum
2007-01  [54.8, 98.3, 61.0]

到目前为止,我试过了

year_groups = df.groupby(df['date'].map(lambda x: x.year))
output = pd.DataFrame()
output['yearly_topic_dist'] = year_groups.apply(lambda x: sum(x['topic_dist']))

所以,我无法弄清楚如何分别对数组中的每个项求和,并输出另一个数组。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

设置

import pandas as pd

df = pd.DataFrame([[1, '2007-01-01', [.2, .5, .3]],
                   [2, '2007-01-02', [.8, .5, .3]]],
                 columns=['doc_id', 'date', 'topic_dist'])

df.date = pd.to_datetime(df.date)

df = df.set_index('date')

解决方案

def topic_adder(s):
    return s.apply(pd.Series).sum().tolist()

df.groupby(pd.TimeGrouper('M'))['topic_dist'].apply(topic_adder)

看起来像:

date
2007-01-31    [1.0, 1.0, 0.6]
Name: topic_dist, dtype: object

答案 1 :(得分:1)

我可能做错了什么,但@ piRSquared的解决方案似乎打破了下面的示例DataFrame,当你分组一个月。虽然它没有打破12个月的组。我想这与跨越一年的日期有关。

另一种选择是将topic_dist列转换为Numpy数组并将np.sum()应用于您的时间组:

from datetime import datetime

import numpy as np
import pandas as pd

df = pd.DataFrame([[1, '2007-01-01', [.2, .5, .3]],
                   [2, '2007-01-02', [.8, .5, .3]],
                   [3, '2008-01-14', [0.1, 0.2, 0.3]]],
                 columns=['doc_id', 'date', 'topic_dist'])


df.date = pd.to_datetime(df.date)

df = df.set_index('date')

df.topic_dist = df.topic_dist.apply(lambda x: np.array(x))

您可以按一个月分组。

# Group by single months
df.groupby(pd.TimeGrouper('M'))['topic_dist'].apply(lambda x: np.sum(x))

date
2007-01-31    [1.0, 1.0, 0.6]
2007-02-28                  0
2007-03-31                  0
2007-04-30                  0
2007-05-31                  0
2007-06-30                  0
2007-07-31                  0
2007-08-31                  0
2007-09-30                  0
2007-10-31                  0
2007-11-30                  0
2007-12-31                  0
2008-01-31    [0.1, 0.2, 0.3]
Name: topic_dist, dtype: object

或按12个月分组:

df.groupby(pd.TimeGrouper('12M'))['topic_dist'].apply(lambda x: np.sum(x))
date
2007-01-31    [1.0, 1.0, 0.6]
2008-01-31    [0.1, 0.2, 0.3]
Name: topic_dist, dtype: object

或其他时间间隔:

df.groupby(pd.TimeGrouper('5M'))['topic_dist'].apply(lambda x: np.sum(x))
date
2007-01-31    [1.0, 1.0, 0.6]
2007-06-30                  0
2007-11-30                  0
2008-04-30    [0.1, 0.2, 0.3]
Name: topic_dist, dtype: object