如何拟合Dirichlet分布的有限混合

时间:2016-05-23 08:50:08

标签: r packages distribution mixture-model dirichlet

我有一个成分样本,我想拟合Dirichlet分布的有限混合。更准确地说,请考虑以下示例:

library(gtools)
set.seed(1)
PROB = c(0.25, 0.15, 0.60)
ALPHA = list(
  c(1,1,1),
  c(2,1,1),
  c(1,1,20)
)
size = 500

N = sapply(1:3, function(i, z) sum(z == i),
           sample(1:3, size, prob = PROB, replace = TRUE))

X = do.call('rbind', 
            sapply(1:3, function(i, N) 
              rdirichlet(N[i], ALPHA[[i]]), N))[sample(1:size),]

X包含由3部分单纯形中定义的Dirichlet分布混合生成的样本。该混合物的第一个Dirichlet分量具有参数(1,1,1),第二个分量具有参数(2,1,1)和第三个(1,1,20)。混合概率为0.25,0.15,0.60。我想从样本中检索这些参数。

您如何找到这些参数?

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

根据theta1 = log(p1 / p3)重新参数化,theta2 = log(p2 / p3)和所有9个alpha参数的日志,然后使用optim()with method =“BFGS”最大化对数似然性似乎如果使用足够接近用于模拟数据的参数值的初始值,则工作。至少,Hessian的所有特征值都是负的,初始值的微小变化导致相同的最优值。

repar <- function(theta) {
  p <- exp(theta[1])
  p[2] <- exp(theta[2])
  p[3] <- 1
  p <- p/sum(p)
  alpha <- matrix(exp(theta[3:11]),3,3,byrow=TRUE)
  list(p=p,alpha=alpha)
}
logL <- function(theta,x) {
  par <- repar(theta)
  p <- par$p
  alpha <- par$alpha
  terms <- 0
  for (i in 1:length(p)) {
    terms <- terms + p[i]*ddirichlet(x,alpha[i,])
  }
  -sum(log(terms))
}
start <- c(log(c(.25,.15)/.6), log(c(1,1,1, 2,1,1, 1,1,20)))
fit <- optim(start,logL,x=X,hessian=TRUE,method="BFGS")
repar(fit$par)
eigen(fit$hessian)$val
fit2 <- optim(start+rnorm(11,sd=.2),logL,x=X,hessian=TRUE,method="BFGS")
repar(fit2$par)