Question

我使用群集，并希望在“R＆＃39; R＆＃39;从任何文件夹在命令行上键入。我不能make install，因为这需要root权限。

我尝试在PATH变量之前和之后将路径附加到我想要的版本。但是，当我点击“R＆＃39;在shell上，它仍然会加载不需要的版本。

这就是我的尝试：

$ export R_HOME="/scratch/mcp50/paks/R-3.2.0/bin/R"
$ export PATH="$R_HOME:$PATH"
$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.2 (2013-09-25) -- "Frisbee Sailing"

Answer 1

在Linux上，可以使用以下命令确定R的默认版本：

which R

which命令使用系统R搜索PATH可执行文件。

对于系统软件包管理员安装的R版本（例如Debian或Ubuntu上的r-base），这将是/usr/bin/R。对于从源安装的R版本，这通常会（但不总是）位于/usr/local/bin/。

如果要覆盖使用的Rscript版本，则可以在bash脚本中明确指定路径，如下所示：

/my/path/to/Rscript script1.R

除了使用bash指定要使用的rscript安装之外，您可以通过编辑R脚本的第一行直接从命令行运行脚本以下#!/usr/bin/Rscript（将/usr/bin替换为您的实际R可执行安装目录。

您的问题中不清楚的是 - 您是否能够在目标系统上获得R的替代版本？

Answer 2

我将PATH指向二进制文件，而不是它所在的目录。 - 猜想

Linux - 覆盖所谓的软件版本

2 个答案: