Question

我在hdf5文件中有一大堆图像，我想加载和分析。每个图像都是1920x1920 uint16并将它们全部加载到内存中会导致计算机崩溃。我被告知其他人通过切割图像来解决这个问题，例如：如果数据是1920x1920x100（100个图像），那么他们读取每个图像的前80行并分析该切片，然后移动到下一个切片。我可以没有问题，但是当我尝试在hdf5文件中创建数据集时，它会得到 TypeError：无法将元素0转换为hsize_t

我可以使用这个非常简化的代码重新创建问题：

with h5py.File('h5file.hdf5','w') as f:
    data = np.random.randint(100, size=(15,15,20))
    data_set = f.create_dataset('data', data, dtype='uint16')

给出输出：

TypeError: Can't convert element 0 ([[29 50 75...4 50 28 36 13 72]]) to hsize_t

我也试过省略“data_set =”和“dtype ='uint16'”，但我仍然得到同样的错误。那么代码就是：

with h5py.File('h5file.hdf5','w') as f:
    data = np.random.randint(100, size=(15,15,20))
    f.create_dataset('data', data)

任何人都可以给我任何关于问题的提示吗？干杯！

Answer 1

create_dataset的第二个参数是形状参数（请参阅docs），但是您传递了整个数组。如果要使用现有数组初始化数据集，则必须使用data关键字指定此项，如下所示：

data_set = f.create_dataset('data', data=data, dtype="uint16")

h5py无法将元素0转换为hsize_t

1 个答案: