如何使用set_cmap为yt.SlicePlot设置colorbar限制?

时间:2016-05-09 14:45:10

标签: python numpy matplotlib colorbar yt-project

我是Python新手,我完全迷失了。 我的主管帮我生成了一个脚本来查看3D速度模型的一些切片:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import yt
from yt.units import km

#Import et reshape data
d = np.genfromtxt('velocity_model.txt', delimiter=' ')
nd=22
nx=131
vel = d[:,3].reshape(nd,nx,nx)
lat = d[:,0].reshape(nd,nx,nx)
lon = d[:,1].reshape(nd,nx,nx)
dep = d[:,2].reshape(nd,nx,nx)
# When this is read into YT, depth increases along x axis, longitude increases along y axis and latitude increases along z axis, need to swap x and z and then flip z
dep=dep.swapaxes(0,2) # swap first and third dimensions: gives lon (x), lat (y), depth (z)
vel=vel.swapaxes(0,2) # swap first and third dimensions: 
lat=lat.swapaxes(0,2) # swap first and third dimensions: 
lon=lon.swapaxes(0,2) # swap first and third dimensions: 
dep=dep[:,:,::-1] # reverse z direction
vel=vel[:,:,::-1] # swap first and 2nd dimensions: 
lat=lat[:,:,::-1] # swap first and 2nd dimensions: 
lon=lon[:,:,::-1] # swap first and 2nd dimensions: 
xmin=0
xmax=289
ymin=0
ymax=289
zmin=-100
zmax=5

#Entrer dans YT
data=dict(velocity=(vel,'km/s'),latitude=(lat,'deg'),longitude=(lon,'deg'),depth=(dep,'km'))
bbox = np.array([[xmin,xmax], [ymin,ymax], [zmin,zmax]])
ds=yt.load_uniform_grid(data,vel.shape, length_unit='km', bbox=bbox)

#Off-Axis Slice
for key in ['latitude','longitude','depth','velocity'] :
     L = [0,0,1] # cutting plane=z
     slicepos=-50
     c = [(xmax-xmin)/2, (ymax-ymin)/2, slicepos]
     cut = yt.SlicePlot(ds, L, key,origin='native',center=c) #, width=(200,90,'km'))
     cut.set_log(key, False)
     cut.annotate_text([0.5,0.9],'z={:d} km'.format(slicepos),coord_system='axis')
     cut.set_cmap(field='velocity',cmap='jet_r')
     cut.save()

使用这个脚本,我想修复颜色条,因为对于每个图像,这个更改,并且这样解释起来并不容易。

我尝试添加这样的限制:

h=colorbar
h.Limits = [5 9]
cut.set_cmap(field='velocity',cmap='jet_r', h)

但这不是好方法。有人有想法吗?我看到了很多东西,但没有看到cmap。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您正在寻找set_zlim功能:

http://yt-project.org/doc/reference/api/generated/yt.visualization.plot_window.AxisAlignedSlicePlot.set_zlim.html

set_cmap功能只允许您选择所需的哪个色彩图,它不允许您设置色彩映射范围。您需要使用set_zlim。这是一个示例,使用http://yt-project.org/data中的一个示例数据集:

import yt
ds = yt.load('IsolatedGalaxy/galaxy0030/galaxy0030')
plot = yt.SlicePlot(ds, 2, 'density')
plot.set_cmap('density', 'viridis')
plot.set_zlim('density', 1e-28, 1e-25)

这会产生以下图像:

enter image description here

答案 1 :(得分:1)

这实际上是关于yt visualization library而不是matplotlib本身的问题 - 我编辑了标题和标签以反映这一点。

我之前从未遇到过,但根据yt.SlicePlot的官方文档,似乎cut将是AxisAlignedSlicePlotOffAxisSlicePlot对象。这两个类都有.set_zlim()方法似乎可以做你想要的:

  

AxisAlignedSlicePlot.set_zlim(*args, **kwargs)

     

设置的比例   颜色映射

     

参数:

     
      
  • 字段:字符串

         

    如果field =='all',则设置色谱图比例的字段适用于所有   地块。

  •   
  • zmin:float

         

    色彩图比例的新最小值。如果'min',   将设置为当前视图中的最小值。

  •   
  • zmax:float

         

    色彩图比例的新最大值。如果'max',将设置为最大值   当前视图中的值。

  •   
     

其他参数:

     
      
  • dynamic_range:float(默认值:无)

         

    图像的动态范围。如果zmin == None,则设置zmin = zmax / dynamic_range如果zmax == None,则设置zmax = zmin * dynamic_range。指定dynamic_range时,默认为设置zmin = zmax / dynamic_range。

  •   

换句话说,您可以使用:

cut.set_zlim(field='velocity', zmin=5, zmax=9)