Question

尝试通过Windows NT上的cygwin界面使用anaconda设置环境，并且失败。

创建环境（conda create -n test_env）运行正常。但是activate test_env失败了。

我试着用它来破解它：

export PATH=/cygdrive/c/users/nick/anaconda3/envs/test:$PATH

这修复了一些行为（which python指向正确的python）。但是，如果我然后执行“conda install”命令，它将安装到根anaconda目录中，而不是环境中。也许导出是bash会话的本地导出，而conda调用不同版本的PATH？有一种方法可以修改PATH全局吗？

Answer 1

在与问题搏斗了很长一段时间之后，我认为我已经实现了将Anaconda的python（和相关环境）集成到Cygwin中的合理且可行的方法。假设你有Cygwin和Anaconda独立工作，要从Cygwin访问所有Anaconda工具，.bash_profile中的以下设置似乎可以解决问题。（我只包括那些与整合有关的.bash_profile部分...希望我不会无意中遗漏一些东西。）

这个设置基本上做了三件事。首先，用户需要将目录$CONDA_BASE_DIR显式设置为安装conda / anaconda / miniconda的基本环境的位置。其次，.bash_profile中有一个功能可以使用shell变量$CONDA_DEFAULT_ENV跟踪当前的conda环境。最后，我们定义了一个别名cyg-conda和一个函数cyg-activate，用作标准conda和activate命令的替换命令。 请注意，变量名$CONDA_DEFAULT_ENV是特殊的，并由实际的conda命令在内部使用。

使用此设置，我可以使用cyg-conda和cyg-activate，就像我在Anaconda命令提示符下通常使用conda和activate一样，同时制作我的Cygwin bash shell可用的环境。

当然可以接受改进建议等等。

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#  Anaconda Environment Selection - Plese set CONDA_BASE_DIR to the directory
#  containing the base installation of anaconda/miniconda.

export CONDA_BASE_DIR=/cygdrive/c/Users/Patrick/Miniconda3

#  Proxy Servers & Network Setup (if needed)

export HTTP_PROXY=
export HTTPS_PROXY=

#  IMPORTANT - Ignore carriage returns when using a Cygwin environment.

export SHELLOPTS
set -o igncr

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#  Manage conda environments for Python.  We check the environment variable
#  $CONDA_DEFAULT_ENV to see which environment is desired.  The default (root)
#  environment will be chosen if nothing is specified.  Note that this variable
#  will be explicitly managed by the cyg-activate ( ) function we have defined
#  below, specifically for the purpose of changing environments.  The root
#  environment is also handled slightly different from the others when it comes
#  to setting the CONDA_DEFAULT_ENV variable.

if [ ${CONDA_DEFAULT_ENV} ] && [ ${CONDA_DEFAULT_ENV} != 'root' ] 
then
    #  SELECT ONE OF THE NON-DEFAULT ENVIRONMENTS
    export CONDA_PREFIX=${CONDA_BASE_DIR}/envs/${CONDA_DEFAULT_ENV}
else
    #  SELECT THE DEFAULT ENVIRONMENT (and set CONDA_DEFAULT_ENV full path)
    export CONDA_DEFAULT_ENV=root
    export CONDA_PREFIX=${CONDA_BASE_DIR}
fi

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#  Define cyg-conda and cyg-activate to facilitate management of conda.

alias cyg-conda=${CONDA_BASE_DIR}/Scripts/conda.exe

cyg-activate() {
    export CONDA_DEFAULT_ENV=$1
    source ~/.bash_profile
    cyg-conda info --envs
}

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#  PATH - ALl of the anaconda/miniconda path entries appear first.

PATH=
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Library/mingw-w64/bin
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Library/usr/bin
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Library/bin
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Scripts
PATH=$PATH:$HOME/scripts
PATH=$PATH:$HOME/local/bin
PATH=$PATH:/usr/local/bin
PATH=$PATH:/usr/bin

export PATH

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Answer 2

由于Cygwin模拟linux环境，我们需要使用“source activate test_env”而不是“activate test_env”。

Answer 3

自conda 4.4起，cygwin现在支持使用以下语法的activate＆deactivate命令（链接的文档还提供了将conda添加到PATH的最佳做法，值得一试）：

conda activate my_env
conda deactivate

但是，有a bug阻止了它们开箱即用，因为cygwin所使用的bash脚本均具有Windows行尾（CRLF）。要解决此问题，有两种选择：

将以下内容添加到您的.bash_profile或.bashrc中（就像@patrickkelly的答案中的脚本中所做的那样）：
```
if [[ "${OSTYPE}" == 'cygwin' ]]; then
    set -o igncr
    export SHELLOPTS
fi
```
使用dos2unix之类的工具将相关文件的行尾更改为Unix样式（LF）。位于conda安装目录中的以下文件必须进行转换，并且可能还有其他文件：
- etc/profile.d/conda.sh
- Scripts/activate
- Scripts/deactivate
更新：当conda自身更新时，至少在某些时候会覆盖上述文件，因此要恢复CRLF行尾，因此必须将它们转换为LF的过程在这种情况下会重复。

Answer 4

使用 env conda 激活和 cygwin 的一种方法是：

打开cmd：Win+R并写入cmd
激活 conda：conda 激活环境
打开 cygwin：cygwin（对于这个 cygwin 必须添加到 PATH）

在Windows上使用带有cygwin的anaconda环境

4 个答案: