带有LIBSVM数据错误的Spark决策树

时间:2016-05-01 05:43:25

标签: python apache-spark pyspark libsvm apache-spark-mllib

我使用Python将CSV转换为LIBSVM数据格式。 LIBSVM的格式如下所示。第一列是目标。

    0 0:1 1:2 2:1 4:11 6:4 7:7 8:1 9:99 10:70 11:1
    0 0:1 1:2 2:1 4:8 5:1 6:3 7:7 8:1 9:99 10:62 11:1

我在Spark中的MLLib决策树中的代码是

    from pyspark.mllib.tree import DecisionTree, DecisionTreeModel
    from pyspark.mllib.util import MLUtils
    from pyspark import SparkContext
    sc = SparkContext()

    data = MLUtils.loadLibSVMFile(sc,"/folder/libdata.txt")
    (trainingData, testData) = data.randomSplit([0.7, 0.3])

    model = DecisionTree.trainClassifier(trainingData)
    print(model.toDebugString())

    model.save(sc, "/folder/myDecisionTreeClassificationModel")

我得到的错误是

    java.lang.IllegalArgumentException: requirement failed: You provided 12 indices and values, which exceeds the specified vector size 11

不知道哪里出错了。数据格式也是正确的。

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这里可能发生的是,在确定数据集中的要素数时,从零开始的要素索引会关闭MLLib。尝试将输入数据中的所有要素索引向上移动1,从1开始到12结束(例如,0 1:1 2:2 3:1 5:11 7:4 8:7 9:1 10:99 11:70 12:1为第一个示例行。)

如果收集并打印data,您可以看到索引0(libsvm)如何成为索引-1(在Spark中)以及最大索引如何为10(对应于libsvm文件中的11)。计算要素数量的代码(请参阅https://github.com/apache/spark/blob/aedbbaa3dda9cbc154cd52c07f6d296b972b0eb2/python/pyspark/mllib/util.py#L120)采用最高索引并添加一个,即11,但您有12个要素。

或者,您可以尝试将正确数量的功能传递到loadLibSVMFile调用(通过numFeatures),但-1索引可能仍然会抛弃。