我有一个逻辑回归来估计嵌套成功,你会在这个链接中找到一些数据:
https://www.dropbox.com/s/okp2iudnace6fha/data1.csv?dl=0
我所有的解释变量都是连续的,以获得线性趋势。我想分析一下巢生存的季节性变化是否随时间发生变化:
年(如0,1,2,3 ......)
产蛋日期(LD)
NestAge
这是我的模特:
glm(survive~LD+yr+yr^2+LD:yr+LD:yr^2+NestAge,family=binomial(link=logexp(data1$exposure)), data=data1)
这是我正在使用的链接曝光:
library(MASS)
logexp <- function(exposure = 1)
{
linkfun <- function(mu) qlogis(mu^(1/exposure))
## FIXME: is there some trick we can play here to allow
## evaluation in the context of the 'data' argument?
linkinv <- function(eta) plogis(eta)^exposure
mu.eta <- function(eta) exposure * plogis(eta)^(exposure-1) *
.Call(stats:::C_logit_mu_eta, eta, PACKAGE = "stats")
valideta <- function(eta) TRUE
link <- paste("logexp(", deparse(substitute(exposure)), ")",
sep="")
structure(list(linkfun = linkfun, linkinv = linkinv,
mu.eta = mu.eta, valideta = valideta,
name = link),
class = "link-glm")
}
为了获得系数,我创建了一个提取但不起作用的循环。
a<-as.matrix(coef(model))
intercept<-a[1,]
slope<-a[2,]
for (i in 1:6) {
i<-as.numeric(i)
sub<-subset(data1,data1$yr==i )
g<- intercept + slope*sub$yr[i]
dsr <-exp(g)/ (1+ exp(g))
}
你能帮我解决一下吗?提前谢谢。
答案 0 :(得分:0)
现在有效:
dsr=0
for (i in 1:6) {
i<-as.numeric(i)
sub<-subset(data1,data1$yr==i )
g<- intercept + slope*sub$yr[i]
dsr [i]<-plogis(g)
}