删除部分NA值的行和列

时间:2016-04-26 18:49:49

标签: r dataframe row na col

我有以下数据框(s):

s<-read.table(text = "V1    V2  V3  V4  V5  V6  V7  V8  V9  V10 
  1 0   62  64  44  NA  55  81  66  57  53  
  2 0   0   65  50  NA  56  79  69  52  55  
  3 0   0   0   57  NA  62  84  76  65  59  
  4 0   0   0   0   NA  30  70  61  41  36  
  5 0   0   0   0   NA  NA  NA  NA  NA  NA  
  6 0   0   0   0   0   0   66  63  51  44  
  7 0   0   0   0   0   0   0   80  72  72  
  8 0   0   0   0   0   0   0   0   68  64  
  9 0   0   0   0   0   0   0   0   0   47  
  10    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   ", header = TRUE)

可以看出,在这种情况下,第5行和第5列仅包含NA0值。我想省略它们并保持行和列的顺序。在同一模式中可能有更多的列和行,我想做同样的事情。可能会更改数据框的大小。 最终结果将是:

    V1  V2  V3  V4  V6  V7  V8  V9  V10 
1   0   62  64  44  55  81  66  57  53  
2   0   0   65  50  56  79  69  52  55  
3   0   0   0   57  62  84  76  65  59  
4   0   0   0   0   30  70  61  41  36  
6   0   0   0   0   0   66  63  51  44  
7   0   0   0   0   0   0   80  72  72  
8   0   0   0   0   0   0   0   68  64  
9   0   0   0   0   0   0   0   0   47  
10  0   0   0   0   0   0   0   0   0   

有没有办法获得省略的行号和列号(在本例中为5)?

4 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您必须详细说明何时要删除。在这种情况下,它看起来像一边的矩阵,对角线总是为0.

但是,一般来说,这就是我使用的

s[!rowSums(is.na(s))>1,!colSums(is.na(s))>1]

考虑0

s[!rowSums(is.na(s)|s==0)>9,!colSums(is.na(s)|s==0)>9]

答案 1 :(得分:3)

我们可以尝试

v1 <- colSums(is.na(s))
v2 <- colSums(s==0, na.rm=TRUE)
j1 <- !(v1>0 & (v1+v2)==nrow(s) & v2 >0)

v3 <- rowSums(is.na(s))
v4 <- rowSums(s==0, na.rm=TRUE)
i1 <- !(v3>0 & (v3+v4)==ncol(s) & v3 >0)
s[i1, j1]
#   V1 V2 V3 V4 V6 V7 V8 V9 V10
#1   0 62 64 44 55 81 66 57  53
#2   0  0 65 50 56 79 69 52  55
#3   0  0  0 57 62 84 76 65  59
#4   0  0  0  0 30 70 61 41  36
#6   0  0  0  0  0 66 63 51  44
#7   0  0  0  0  0  0 80 72  72
#8   0  0  0  0  0  0  0 68  64
#9   0  0  0  0  0  0  0  0  47
#10  0  0  0  0  0  0  0  0   0

假设我们改变's'中的一个值

 s$V7[3] <- NA

通过运行上面的代码,输出将是

#   V1 V2 V3 V4 V6 V7 V8 V9 V10
#1   0 62 64 44 55 81 66 57  53
#2   0  0 65 50 56 79 69 52  55
#3   0  0  0 57 62 NA 76 65  59
#4   0  0  0  0 30 70 61 41  36
#6   0  0  0  0  0 66 63 51  44
#7   0  0  0  0  0  0 80 72  72
#8   0  0  0  0  0  0  0 68  64
#9   0  0  0  0  0  0  0  0  47
#10  0  0  0  0  0  0  0  0   0

注意:OP的条件是仅包括NA和0值。我想省略它们

答案 2 :(得分:3)

我打算建议:

sclean <- s[rowSums(s == 0|is.na(s)) != ncol(s) | (rowSums(s == 0, na.rm=TRUE) == ncol(s)),
        colSums(s == 0|is.na(s) )!= nrow(s) | colSums(s == 0, na.rm=TRUE) == nrow(s)]

答案 3 :(得分:1)

您可以尝试以下方法:

myRowSums <- rowSums(is.na(s) | s == 0)
myColSums <- colSums(is.na(s) | s == 0)

sSmall <- s[which(myRowSums != ncol(s)), which(myColSums != nrow(s))]

它适用于以下数据集,以删除完全由0和NA组成的所有列和行。

s <- data.frame(a=c(0, rnorm(5), 0), b=c(0, rnorm(2), NA, NA,1, NA), c=c(rep(c(0,NA), 3), 0))