在热图中打破

Question

我正在尝试在热图中使用中断：

col_breaks = c(seq(-4,-1.99999,length=100), 
                seq(-2,1.999999,length=100),
                seq(2,4,length=100));
 png("../graphs/mRNA_levels.png",
     width = 5*300,
     height = 5*300,
     res = 300,
     pointsize = 8
 );
 heatmap.2(x = t(scale(t(exp.data.breast))),
           main = "chemokine levels in tumour samples",
           trace = "none",
           margins = c(5,5),
           col = my_palette,
           breaks=col_breaks                                       
    );

我收到此错误。

  

image.default错误（1：nc，1：nr，x，xlim = 0.5 + c（0，nc），ylim = 0.5 +：     必须有一个比颜色更多的突破

有人能以简单的方式解释问题是什么吗？

Answer 1

您是否正确设置了colorRampPalette？检查一下，例如使用三种不同的颜色，如：

my_palette<- colorRampPalette(c("white","lightskyblue","navyblue"))

如果这不起作用，那么尝试删除seq参数中的长度以查看它是否适用于defult。