R,JAGS,r2jags:访问`for`循环

时间:2016-04-24 06:33:11

标签: r jags r2jags

我正在研究实验设计问题,并尝试通过JAGSR填充r2jags模型。

要测量遗留效应,我必须访问其中一个变量的列表中的i-1元素。当i=1时,此变量必须返回其值列表中的最后一项。我尝试使用ifelse()但是没有用。

我尝试了什么:

for (i in 1:Ntotal){
    j <- ifelse(i==1,Ntotal,j)
    y[i] ~ dnorm(y.hat[i], tau)
    y.hat[i] <- mu + beta*a[i] + tau_d*b[i]*period[i] + rho*product[j] + epsilon[i]
    epsilon[i] ~ dnorm(0, tau)  # gaussian error
    }

我收到错误:

Error in jags.model(file = "TEMPmodel.txt", data = dataList, n.chains = 3,  : 
  RUNTIME ERROR:
Compilation error on line 7.
Possible directed cycle involving j

对于如何实现我的解决方案的任何见解表示赞赏。

R中我想要实现的一个简单例子,如果上述情况不明确的话。对于变量d,我必须访问前面的元素。从索引的开头开始,前面的元素是最后一个元素。对于JAGS,我不确定如何编写模型来执行此操作。

i = 1
exam <- data.frame(a=c(5,6,7), b=c(10,11,12), d=c(20,21,22))

exam$a[i] + exam$b[i] + exam$d[i-1]

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

这行代码存在一些值得指出的问题:

j <- ifelse(i==1,Ntotal,j)

首先,它在for循环中,所以你试图重新定义节点j - 所以你必须用i索引j。其次,j被定义为自身 - 因此定向循环消息。以下代码执行我认为您想要的内容:

m <- 'model{

    for(i in 1:10){
        j[i] <- ifelse(i==1, 10, i-1)
    }

    #monitor# j
}'

runjags::run.jags(m)

但是,在R中将j作为虚拟变量并将其作为数据提供给JAGS可能更简单,例如:

m <- 'model{

    for(i in 1:N){
        new[i] <- j[i]
        # Or something else involving j[i]
    }

    #monitor# new
    #data# j, N
}'

N <- 10
j <- c(2:N, 1)
runjags::run.jags(m)

无论哪种方式,每当你引用j时,你都需要用i来索引它 - 例如:

product[j[i]]

马特