如何在文件

Question

我有一个像

这样的文件

-1  1 -1
2  -1  2
-1  2  0

我想通过

挤压元素“-1”

tr -s  '-1' file

但它不起作用。

ADDED

我使用vcftools将vcf.gz更改为矩阵，元素为“0”，“1”或“2”（例如，chr1.012）（缺失值为“-1”）。但我发现每行的长度不同。所以我怀疑是否是因为“-1”。所以我想挤压“-1”元素。

Answer 1

它无法使用tr，因为：

• -1将被视为包含两个字符-和1的字符集，而不是一个令牌-1

• 即使您只有一个字符，也需要将这些事件与tr应用挤压操作相邻

Answer 2

您可以在sed

中实现类似的功能

$ echo "-1-1-1 2 -1" | sed -r 's/(-1)+/-1/g'
-1 2 -1

用一个实例替换-1 s的连续流。