您的参考示例：

Question

我正在尝试从基因组数据集上的DMwR包运行knnImputer。数据集有两列 - 一列用于染色体上的位置（数字，整数），另一列用于甲基化值（也是数字，双精度），其中许多甲基化值缺失。这个想法是距离应该基于染色体中的位置。我还有其他几个功能，但选择不包括那些）。但是，当我运行以下行时，我收到错误。

reg.knn <- knnImputation(as.matrix(testp), k=2, meth="median")
#ERROR:
#Error in rep(1, ncol(dist)) : nvalid 'times' argument

有关可能导致此问题的任何想法？如果这不起作用，是否有人知道R包装中其他任何好的KNN Imputers？我一直在尝试几种，但每种都会返回某种错误。

Answer 1

我今天也遇到了类似的错误：

rep（1，ncol（dist））出错：无效的'times'参数

我无法在线找到解决方案，但有一些线索和错误，我认为问题是否。数据框中的列

尝试至少传递'3'列并进行KNNimputation

我创建了一个虚拟列，它给出了观察的ROW计数（作为第三列）。

它对我有用！

您的参考示例：

示例1 -

temp <- data.frame(X = c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10), Y = c(T, T, F, F,F,F,NA,NA,T,T))
temp7<-NULL temp7 <-knnImputation(temp,scale=T,k=3, meth='median', distData = NULL)

rep（1，ncol（dist））出错：无效的'times'参数

示例2 -

temp <- data.frame(X = 1:10, Y = c(T, T, F, F,F,F,NA,T,T,T), Z = c(NA,NA,7,8,9,5,11,9,9,4)) 
temp7<-NULL temp7 <-knnImputation(temp,scale=T,k=3, meth='median', distData = NULL)

此处传递的列数为3.没有收到任何错误！

Answer 2

当我读入代码时，我找到了问题，如果列小于3，那么在这个过程中它降级到不是数据帧的东西，因此基于数据帧结构的操作都失败了，我认为作者应该处理这个案子。

是的，最后的答案也是通过审判，不同的道路，同样的答案找到它

Answer 3

今天，我遇到了同样的错误。我的 df 比 3 列大得多，所以这似乎不是（唯一的？）问题。

我发现 NA 过多的行导致了问题（在我的例子中，给定行的 95% 以上是 NA）。过滤掉这一行解决了问题。

带回家的信息：不仅要过滤列上的 NA（我这样做了），还要检查行（如果您无法定义最近邻的确切含义，当然不可能通过 kNN 进行估算）。

如果包能提供可读的错误信息就好了！

来自DMwR包的knnImputer出错：无效的'times'参数

3 个答案:

您的参考示例：