如何在终端中查看通过qsub提交的作业的输出？

Question

我通过qsub向SGE提交这个简单的工作。如何查看作业的输出，这是我终端中的简单回显。我的意思是我想直接在屏幕上将其输出到日志文件或其他东西。

所以这是存储在Dummyjob中的作业：

#!/bin/sh
#$ -j y
#$ -S /bin/sh
#$ -q long.q

sleep 30
echo "I'm done!"

这是qsub命令：

qsub -N job_1 -cwd./Dummyjob

谢谢！

Answer 1

它没有那样做。您指的是批量工具，例如 How to submit a job using qsub 。

查看命令行选项，这些是可能的：

-o <output_logfile> name of the output log file
-e <error_logfile> name of the error log file
-m ea Will send email when job ends or aborts

您可以要求它在作业完成后发送邮件（成功与否）。或者你可能能够写入 fifo ，例如，在一个终端中你会做

mkfifo myFakeFile
tail -f myFakeFile

然后使用

-o myFakeFile

提交时（按此顺序，等待某事等待）。但是如果程序进行任何检查，它将不会写入fifo（因为它不是常规文件）。

进一步阅读：

• qsub - submit a batch job to Sun Grid Engine.
• 6.3.2 Creating a FIFO（Linux程序员指南）

Answer 2

之前的回答提到您正在提交“批处理作业脚本”，这是正确的，因此您不会在终端上看到输出（tty），但stdout / stderr将被发送到输出文件。但是，这并不意味着您无法通过Grid Engine运行交互式作业。你可以，只使用'qrsh'而不是'qsub'，脚本将在Grid Engine选择的远程机器上运行 - 结果将显示在你的屏幕上。

注意：您可能必须在Grid Engine群集中配置qrsh才能使其正常工作。