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Question

我刚刚使用

将Python的MATLAB Engine API安装到我的主目录

$ python setup.py build --build-base=$HOME install --prefix=$HOME

然而，当我尝试从Jupyter笔记本中import matlab.engine时，我收到以下错误：

---------------------------------------------------------------------------
EnvironmentError                          Traceback (most recent call last)
<ipython-input-2-833daa01cd46> in <module>()
      8 import numpy as np
      9 import matplotlib.pyplot as plt
---> 10 import matlab.engine
     11 
     12 from dopa_net.behavioral_experiments.analysis_code import behavior_analysis as ba

/home/despo/dbliss/lib/matlab/engine/__init__.py in <module>()
     57         pythonengine = importlib.import_module("matlabengineforpython"+_PYTHONVERSION)
     58     except:
---> 59         raise EnvironmentError('The installation of MATLAB Engine for Python is '
     60                                 'corrupted.  Please reinstall it or contact '
     61                                 'MathWorks Technical Support for assistance.')

EnvironmentError: The installation of MATLAB Engine for Python is corrupted.  Please reinstall it or contact MathWorks Technical Support for assistance.

奇怪的是，当我从{Jupyter笔记本所在目录中的IPython shell 中import matlab.engine时，我没有收到此错误。我不仅可以从shell导入引擎 - 它在shell中工作，这向我展示没有任何损坏：

In [1]: import matlab.engine In [2]: eng = matlab.engine.start_matlab() In [3]: tf = eng.isprime(37) In [4]: print tf True

任何想法发生了什么？

N.B。我今天早些时候确实在我的主目录中安装了一个版本的引擎，但我尝试（并且我认为我做了）卸载它。我的猜测是它的某些部分被遗忘并造成麻烦。但是为什么它只为Jupyter造成麻烦，而不是为IPython shell造成麻烦？（你怎么想我应该摆脱它？）

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我将错误跟踪到__init__.py模块的matlab.engine文件中的以下行：

importlib.import_module("matlabengineforpython2_7")

它不会在IPython shell中引发错误，但会在Jupyter中引发以下错误：

--------------------------------------------------------------------------- ImportError Traceback (most recent call last) <ipython-input-4-831d184262c4> in <module>() ----> 1 importlib.import_module("matlabengineforpython2_7") /usr/local/anaconda-2.4.0/lib/python2.7/importlib/__init__.pyc in import_module(name, package) 35 level += 1 36 name = _resolve_name(name[level:], package, level) ---> 37 __import__(name) 38 return sys.modules[name] ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.15' not found (required by /srv/local/matlab-2015a/extern/engines/python/dist/matlab/engine/glnxa64/../../../../../../../bin/glnxa64/libmwfl.so)

我不知道这里发生了什么。

Answer 1

IPython Shell和Jupyter Notebook无法访问相同C库的假设似乎是正确的。为什么会这样，我不知道。这两个是作为同一个软件包的一部分安装的，使用相同版本的Python等。

将以下行添加到我的.bashrc shell配置文件中修复了问题：

export LD_LIBRARY_PATH=XXX

其中XXX是包含libstdc++.so.6版本的目录我希望Jupyter Notebook使用（而且IPython Shell已经使用过）。

matlab.engine的导入在IPython中工作，但在Jupyter中不起作用

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1 个答案: