如何修改变量及其在netcdf中的相应维度

时间:2016-03-18 02:22:58

标签: matlab netcdf nco

我正在使用大气模型进行理想化实验,输出格式为netcdf。但是netcdf文件头并没有清楚地描述变量和维度。例如:

netcdf qc3d {
dimensions:
    Time = UNLIMITED ; // (1453 currently)
    bottom_top = 45 ;
    south_north = 32 ;
    west_east = 12288 ;
variables:
    float Time(Time) ;
        Time:axis = "Time" ;
        Time:long_name = "Time" ;
        Time:standard_name = "Time" ;
        Time:units = "minutes since 1900-01-01 " ;
    double zc(bottom_top) ;
        zc:axis = "Z" ;
        zc:long_name = "vertical height of model layers, MSL" ;
        zc:standard_name = "altitude" ;
        zc:units = "m" ;
        zc:positive = "up" ;
    double yc(south_north) ;
        yc:axis = "Y" ;
        yc:long_name = "y-coordinate of grid cell centers in Cartesian system" ;
        yc:units = "m" ;
    double xc(west_east) ;
        xc:axis = "X" ;
        xc:long_name = "x-coordinate of grid cell centers in Cartesian system" ;
        xc:units = "m" ;
    float qc(Time, bottom_top, south_north, west_east) ;
        qc:long_name = "cloud water mixing ratio" ;
        qc:standard_name = "cloud_water_mixing" ;
        qc:units = "kg kg-1" ;
        qc:_FillValue = 9.96921e+36f ;
        qc:missing_value = 9.96921e+36f ;

// global attributes:
        :model_tag = "CSU VVM" ;
        :references = "http://kiwi.atmos.colostate.edu/pubs/joon-hee-tech_report.pdf" ;
        :contact = "jung@atmos.colostate.edu" ;
        :institution = "Colorado State University" ;
        :VVM_casename = "GATE_PHASE_III                                                                  " ;
}

有4个维度,时间(时间),zc(bottom_top),yc(south_north),xc(west_east)和5变量,其中前4个变量应该是第五个变量的维度,因此称为qc。但似乎没有。维度只是一个从1到45的序列号索引,32 ......不管怎样。

我想计算一些变量,它是压力的函数。在CDO中,脚本就像这样

cdo expr,"pottemp=temp*((100000/clev(temp))^0.287);"  ifile pottemp.nc

(此代码来自here

但我只是获得了一系列索引,如1,2,3 ......当我使用这个函数时,不是真正的压力级别,clev(qv)。 那么如何重写变量维度,如qc from qc(Time, bottom_top, south_north, west_east) ;qc(Time, zc, yc, xc) ; 我认为我可以在matlab中完成这个,但我只是不想打开这个数据集,因为它的大小太大了......所以我试图找到一些像ncks或cdo这样的工具,但仍然没有做到此

非常感谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

使用NCO尝试

ncap2 -s 'pottemp=temp*((100000/zc)^0.287)' in.nc out.nc

ncap2 documentation

扩展答案以涵盖下面的其他问题:

首先使用ncap2将zc显式设置为ascii文件中的值:

ncap2 -s 'zc[$zc]={1.5,900,2500,3500}' in.nc out.nc

(假设zc是4号尺寸)。然后根据zc定义pottemp。