主成分订单 - R中的PCA

时间:2016-03-17 00:06:04

标签: r statistics pca

我正在尝试使用principal在R中执行PCA。实际上,我做了,但我很好奇为什么我的主要竞争对手不是以数字方式订购的?我的意思是他们为什么是PC1,PC2,PC3。这有什么关系?

tb2 <- principal(tba, nfactors = 4)
tb2
Principal Components Analysis
Call: principal(r = tba, nfactors = 4)
Standardized loadings (pattern matrix) based upon correlation matrix
        PC2   PC3   PC1   PC4   h2     u2 com
bio1   0.89  0.28  0.32 -0.05 0.98 0.0248 1.5
bio2  -0.07 -0.22  0.09  0.96 0.99 0.0091 1.1
bio3   0.63  0.21 -0.22  0.60 0.85 0.1497 2.5
bio4  -0.60 -0.40  0.34  0.44 0.83 0.1682 3.3
bio5   0.78  0.15  0.46  0.33 0.95 0.0454 2.1
bio6   0.89  0.36  0.17 -0.21 0.99 0.0088 1.5
bio7  -0.50 -0.38  0.26  0.70 0.96 0.0395 2.8
bio8   0.85  0.12  0.20 -0.19 0.81 0.1896 1.3
bio9   0.85  0.24  0.41  0.03 0.95 0.0525 1.6
bio10  0.85  0.23  0.40  0.04 0.95 0.0533 1.6
bio11  0.90  0.34  0.21 -0.13 0.99 0.0058 1.4
bio12  0.16  0.94  0.03 -0.15 0.93 0.0743 1.1
bio13  0.29  0.93  0.18 -0.09 0.99 0.0086 1.3
bio14 -0.31 -0.18 -0.89 -0.05 0.92 0.0777 1.3
bio15  0.34  0.72  0.56 -0.02 0.94 0.0577 2.4
bio16  0.27  0.93  0.22 -0.10 0.99 0.0069 1.3
bio17 -0.17 -0.16 -0.93 -0.07 0.93 0.0725 1.1
bio18 -0.40 -0.29 -0.84 -0.06 0.96 0.0440 1.7
bio19  0.26  0.93  0.22 -0.09 0.99 0.0066 1.3

                       PC2  PC3  PC1  PC4
SS loadings           6.84 4.99 3.81 2.26
Proportion Var        0.36 0.26 0.20 0.12
Cumulative Var        0.36 0.62 0.82 0.94
Proportion Explained  0.38 0.28 0.21 0.13
Cumulative Proportion 0.38 0.66 0.87 1.00

Mean item complexity =  1.7
Test of the hypothesis that 4 components are sufficient.

The root mean square of the residuals (RMSR) is  0.03 
 with the empirical chi square  96803.04  with prob <  0 

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