我在进程之间传递大型向量进行数值模拟。一切正常,直到某个时间步。我没有收到错误,但输出解决方案显然不正确。
我现在调试了很长一段时间,我的假设是MPI通信出错。
我的代码的通信部分如下所示:
MPI_Request req;
for(int j=0;j<numProcs;j++){
if(j!=myId){
tag=0;
sizeToSend=toProc[j].size();
MPI_Isend(&sizeToSend, 1, MPI_LONG_LONG, j, tag, MPI_COMM_WORLD,&req);
MPI_Request_free(&req);
}
}
for(int j=0;j<numProcs;j++){
if(j!=myId){
tag=0;
MPI_Recv(&sizeToReceive[j], 1, MPI_LONG_LONG, j, tag, MPI_COMM_WORLD, MPI_STATUS_IGNORE);
}
}
for(int j=0;j<numProcs;j++){
if(j!=myId){
if(toProc[j].size()>0){
tag=1;
MPI_Isend(&toProc[j][0], toProc[j].size(), MPI_LONG_LONG, j, tag, MPI_COMM_WORLD,&req);
MPI_Request_free(&req);
}
}
}
for(int j=0;j<numProcs;j++){
if(j!=myId){
if(sizeToReceive[j]>0){
receiveBuffer.resize(sizeToReceive[j]);
tag=1;
MPI_Recv(&receiveBuffer[0], sizeToReceive[j], MPI_LONG_LONG, j, tag, MPI_COMM_WORLD, MPI_STATUS_IGNORE);
for(int k=0;k<sizeToReceive[j];k++){
domain.field[receiveBuffer[k]]=1;
}
receiveBuffer.clear();
}
}
}
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
for(int j=0;j<toProc.size();j++){
toProc[j].clear();
}
变量numProcs
是一个包含进程数的int,myId
是一个包含进程&#39;等级,tag
是一个整数,domain.field
是一个vector<char>
。
其他必要的变量定义如下:
vector<vector <long long> > toProc;
toProc.resize(numProcs);
long long sizeToReceive[numProcs];
long long sizeToSend=0;
vector<long long> receiveBuffer;
我在上面的代码中尝试做的是将向量toProc[j]
发送到每个进程的id==j for j=0,...,numProcs-1, j!=myId
处理。
为了达到这个目的,我在前两个for循环中发送和接收这些向量的大小,并在第3和第4个for循环中发送和接收实际数据。我正在使用Isend,因为我显然希望这些调用是非阻塞的。
toProc[j]
中的值是索引,必须在进程j的向量domain.field中设置为1(每个进程都有自己的domain.field)。
我的问题是: 您是否认为我使用Isend-Recv策略时可能会出现意外行为。
答案 0 :(得分:2)
您正在为多个Chloe O’Brian
请求重用变量,而无需等待完成。
MPI Standard:3.7.2和3.7.4关于ISend
非阻塞发送呼叫表示系统可能开始复制 数据超出发送缓冲区。发件人不应修改任何部分 调用非阻塞发送操作后的发送缓冲区,直到 发送完成。
这意味着,在发送完成之前,您不得覆盖MPI_Request_free
。
将请求对象标记为取消分配并将请求设置为 MPI_REQUEST_NULL。正在进行的与之相关的沟通 请求将被允许完成。该请求将被取消分配 只有在完成之后。
这意味着,sizeToSend
之后无法保证完成发送。
您可以重新构建代码以将MPI_Request_free
保留在向量中,并将打开的请求保留在向量中以正确sizeToSend
。但我建议只使用MPI_Waitall
和MPI_Alltoall
进行整个操作。