通过优化MATLAB / Python中的多个变量来减少两个图之间的差异?

时间:2016-03-09 21:30:08

标签: python matlab optimization curve-fitting levenberg-marquardt

假设' h'是x,y,z和t的函数,它给出了一条图线(t,h)(模拟)。同时我们也观察到了图(h对t的观察值)。如何通过优化x,y和z的值来减少观测(t,h)和模拟(t,h)图之间的差异?我想改变模拟图形,以便它在MATLAB / Python中越来越接近观察到的图形。在文献中我读到人们用Lavenberg-marquardt算法做了同样的事情,但不知道怎么做?

1 个答案:

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您实际上正在尝试拟合参数化函数x,y,z的参数h(x,y,z;t)

MATLAB

你是对的,在MATLAB中你应该使用优化工具箱的lsqcurvefit,或曲线拟合工具箱的fit(我更喜欢后者)。

查看lsqcurvefit的文档:

x = lsqcurvefit(fun,x0,xdata,ydata);

在文档中,您说模型F(x,xdata)包含系数x和采样点xdata,以及一组测量值ydata。该函数返回最小二乘参数集x,您的函数最接近测量值。

拟合算法通常需要起点,一些实现可以随机选择,如果lsqcurvefit这是x0的原因。如果你有

h = @(x,y,z,t) ... %// actual function here
t_meas = ... %// actual measured times here
h_meas = ... %// actual measured data here

然后在lsqcurvefit

的约定中
fun   <--> @(params,t) h(params(1),params(2),params(3),t)
x0    <--> starting guess for [x,y,z]: [x0,y0,z0]
xdata <--> t_meas
ydata <--> h_meas

您的函数h(x,y,z,t)应该在t中进行矢量化,这样对于t中的向量输入,返回值与t的大小相同。然后调用lsqcurvefit将为您提供最佳参数集:

x = lsqcurvefit(@(params,t) h(params(1),params(2),params(3),t),[x0,y0,z0],t_meas,h_meas);
h_fit = h(x(1),x(2),x(3),t_meas);  %// best guess from curve fitting

的Python

在python中,你必须使用scipy.optimize模块,尤其是scipy.optimize.curve_fit。根据上述约定,您需要具备以下内容:

import scipy.optimize as opt

popt,pcov = opt.curve_fit(lambda t,x,y,z: h(x,y,z,t), t_meas, y_meas, p0=[x0,y0,z0])

请注意,p0起始数组是可选的,但如果缺少,则所有参数都将设置为1。您需要的结果是popt数组,其中包含[x,y,z]的最佳值:

x,y,z = popt
h_fit = h(x,y,z,t_meas)