线密度为R和spatstat

Question

我使用R和spatstat包使用pixellate函数（spatstat）创建血管轨迹的密度图。我能够创建一个地图并绘制轨迹密度。

现在我想改进地图的设计，并做一些像Niels Willems（Google Scholar）创建的地图。下图给出了我要实现的目标示例。你知道我能做些什么来获得这种3D效果吗？

感谢您的帮助，

阿诺

Answer 1

如果原始轨迹被表示为类psp的对象（线段模式），那么您可以使用spatstat::density.psp来计算这种平滑图像。但是如果你已经使用pixellate.psp将它们转换为像素图像（像素值告诉你每个像素的轨迹长度），那么你可以使用spatstat::blur来获得平滑的图像。